RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584377.5

CSNK1D-222, Transcript of casein kinase 1 delta, human

TSL 2

Gene CSNK1D, Length 2,891 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1D-222	ENST00000584377	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	RNF157	Q96PX1	679 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	PDHA1	P08559	390 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	TSHR	P16473	764 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	ALDH3A1	P30838	453 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	SNAPC2	Q13487	334 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	PMF1	Q6P1K2	205 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	CYTH2	Q99418	400 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	GJA5	P36382	358 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	GRM5	P41594	1212 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	CCNA1	P78396	465 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	KCNJ11	Q14654	390 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	SETDB1	Q15047	1291 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	PDK2	Q15119	407 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	GRIK4	Q16099	956 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	BOLA3	Q53S33	107 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	ACOT1	Q86TX2	421 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	PLD5	Q8N7P1	536 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	MZB1	Q8WU39	189 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	FAF2	Q96CS3	445 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	GINS2	Q9Y248	185 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	GOLGA8R	I6L899	631 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	ADRA1D	P25100	572 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	SDC4	P31431	198 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	TTC30A	Q86WT1	665 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	SBF1	O95248	1867 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	KBTBD13	C9JR72	458 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	KCNN4	O15554	427 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	COQ9	O75208	318 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	PYGB	P11216	843 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	GNAZ	P19086	355 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	IL4R	P24394	825 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	BCAR1	P56945	870 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	CUL3	Q13618	768 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	ASRGL1	Q7L266	308 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	TRIM4	Q9C037	500 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	USP29	Q9HBJ7	922 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	PAK5	Q9P286	719 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	DPYSL4	O14531	572 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	APOL1	O14791	398 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	CHAD	O15335	359 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	FGFR1	P11362	822 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	SLC6A3	Q01959	620 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	USP4	Q13107	963 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	ZNF410	Q86VK4	478 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	BANP	Q8N9N5	519 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	ERP27	Q96DN0	273 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	HESX1	Q9UBX0	185 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	PPEF2	O14830	753 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	AVIL	O75366	819 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	UNC5C	O95185	931 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	CCNB1	P14635	433 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CSNK1D-222	ENST00000584377	DES	P17661	470 aa		13.73	□□□□□ -0.21

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