RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	NDST4	Q9H3R1	872 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	IL23A	Q9NPF7	189 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	PANK4	Q9NVE7	773 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	RAB21	Q9UL25	225 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	GDA	Q9Y2T3	454 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A087X1B8	175 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289		B4DLN1	442 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289		F5H6K3	240 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	TRAF5	O00463	557 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	DAPK3	O43293	454 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	AKR1B10	O60218	316 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	GFPT2	O94808	682 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CYP3A4	P08684	503 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	IDE	P14735	1019 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	RPA1	P27694	616 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CASP1	P29466	404 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CDC25A	P30304	524 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CIITA	P33076	1130 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	SHMT1	P34896	483 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	EPS15	P42566	896 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	PAFAH1B1	P43034	410 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	MAN2A2	P49641	1150 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	VAV2	P52735	878 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	ADAM8	P78325	824 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	KLRC3	Q07444	240 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	DDR1	Q08345	913 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	PICALM	Q13492	652 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	TERF2	Q15554	542 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	MFSD5	Q6N075	450 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CLEC14A	Q86T13	490 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	C7orf31	Q8N865	590 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	MAF1	Q9H063	256 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	MED4	Q9NPJ6	270 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	SNED1	Q8TER0	1413 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	UBE2QL1	A1L167	161 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	MYMK	A6NI61	221 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	PP2D1	A8MPX8	630 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CBX4	O00257	560 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CES2	O00748	559 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	PDXK	O00764	312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	PJA2	O43164	708 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	TOX4	O94842	621 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	SERPING1	P05155	500 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	PLA2G4B	P0C869	781 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	ABCD1	P33897	745 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	SREBF1	P36956	1147 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	ARHGAP25	P42331	645 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	MAGEA1	P43355	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	SCNN1G	P51170	649 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 130.7 ms