RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 APOL2Q9BQE5 337 aa21.98■■□□□ 1.11
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PTPRM-211ENST00000580170 PCNX4Q63HM2 1172 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRM-211ENST00000580170 ADGRF2Q8IZF7 708 aa21.98■■□□□ 1.11
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PTPRM-211ENST00000580170 TP53BP2Q13625 1128 aa21.98■■□□□ 1.11
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PTPRM-211ENST00000580170 ARL4DP49703 201 aa21.97■■□□□ 1.11
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PTPRM-211ENST00000580170 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa21.97■■□□□ 1.11
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PTPRM-211ENST00000580170 POLE3Q9NRF9 147 aa21.95■■□□□ 1.1
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PTPRM-211ENST00000580170 MIB1Q86YT6 1006 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 MCOLN2Q8IZK6 566 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRM-211ENST00000580170 JADE3Q92613 823 aa21.95■■□□□ 1.1
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