RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568514.5

SNAP23-218, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 3

Gene SNAP23, Length 1,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-218	ENST00000568514	SLC11A2	P49281	568 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-218	ENST00000568514	RIPK4	P57078	832 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-218	ENST00000568514	CTBP1	Q13363	440 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-218	ENST00000568514	GALE	Q14376	348 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-218	ENST00000568514	LY6K	Q17RY6	165 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-218	ENST00000568514	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-218	ENST00000568514	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-218	ENST00000568514	EMC10	Q5UCC4	262 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-218	ENST00000568514	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-218	ENST00000568514	NPNT	Q6UXI9	565 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-218	ENST00000568514	KSR2	Q6VAB6	950 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-218	ENST00000568514	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-218	ENST00000568514	NGEF	Q8N5V2	710 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-218	ENST00000568514	VOPP1	Q96AW1	172 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-218	ENST00000568514	FKBP10	Q96AY3	582 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-218	ENST00000568514	FAM136A	Q96C01	138 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-218	ENST00000568514	RUNDC1	Q96C34	613 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-218	ENST00000568514	TIFA	Q96CG3	184 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-218	ENST00000568514	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-218	ENST00000568514	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-218	ENST00000568514	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-218	ENST00000568514	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-218	ENST00000568514	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-218	ENST00000568514	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-218	ENST00000568514	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-218	ENST00000568514	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-218	ENST00000568514	MAP3K5	Q99683	1374 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-218	ENST00000568514	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-218	ENST00000568514	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-218	ENST00000568514	MEGF6	O75095	1541 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SNAP23-218	ENST00000568514	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		4.09	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	ZNF213	O14771	459 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	CREB3	O43889	395 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	TUSC2	O75896	110 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	CHEK2	O96017	543 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	VCAM1	P19320	739 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	ADORA2A	P29274	412 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	KCNJ5	P48544	419 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	ARFIP2	P53365	341 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	SLC39A6	Q13433	755 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	GRM3	Q14832	879 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	LONRF3	Q496Y0	759 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	MCM10	Q7L590	875 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	NRAP	Q86VF7	1730 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	DENND1C	Q8IV53	801 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	PJA1	Q8NG27	643 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	SLC9A6	Q92581	669 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	UROC1	Q96N76	676 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	DISP2	A7MBM2	1401 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	ANO9	A1A5B4	782 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514		H3BML4	177 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	TRIAP1	O43715	76 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	CSF1R	P07333	972 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	EBLN1	P0CF75	366 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	ITGAL	P20701	1170 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	NXPH1	P58417	271 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	ITIH3	Q06033	890 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	MORC3	Q14149	939 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	DCTN1	Q14203	1278 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	FGL2	Q14314	439 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	BRD3	Q15059	726 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	TREML2	Q5T2D2	321 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	SLC15A4	Q8N697	577 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	IL31RA	Q8NI17	732 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	REPS1	Q96D71	796 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	PBK	Q96KB5	322 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	HAPLN3	Q96S86	360 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SNAP23-218	ENST00000568514	TIMP4	Q99727	224 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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