RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566637.5

CTU2-208, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTU2, Length 1,619 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-208ENST00000566637 NPY6RQ99463 290 aa21.48■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 FBXO44Q9H4M3 255 aa21.48■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa21.48■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 M0QYT0 321 aa21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 CDKN2BP42772 138 aa21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 GPR15P49685 360 aa21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 ROR1Q01973 937 aa21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 KRT17Q04695 432 aa21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 KAZNQ674X7 775 aa21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 MAATS1Q7Z4T9 603 aa21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 HERC6Q8IVU3 1022 aa21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 MAP7D3Q8IWC1 876 aa21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 SLC7A14Q8TBB6 771 aa21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 NT5C3BQ969T7 300 aa21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 PNKPQ96T60 521 aa21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 HOMER3Q9NSC5 361 aa21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 MYO16Q9Y6X6 1858 aa21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 MDM4O15151 490 aa21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 RAD51CO43502 376 aa21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 RPL17P18621 184 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 OR1D2P34982 312 aa21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 CDH6P55285 790 aa21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 DEUP1Q05D60 604 aa21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 PDK2Q15119 407 aa21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 CYP1B1Q16678 543 aa21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 SDHAF4Q5VUM1 108 aa21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 SYPL2Q5VXT5 272 aa21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 BSPRYQ5W0U4 402 aa21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 BEND5Q7L4P6 421 aa21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 TTC9BQ8N6N2 239 aa21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 STIM2Q9P246 746 aa21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 RAB21Q9UL25 225 aa21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 EFR3BQ9Y2G0 817 aa21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa21.47■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 WDR27A2RRH5 827 aa21.46■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 ADAM12O43184 909 aa21.46■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 FYNP06241 537 aa21.46■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 KRT10P13645 584 aa21.46■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 SLC7A5Q01650 507 aa21.46■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 ERMARDQ5T6L9 678 aa21.46■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 BTBD8Q5XKL5 378 aa21.46■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 WDR93Q6P2C0 686 aa21.46■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 VPS52Q8N1B4 723 aa21.46■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 ARHGAP18Q8N392 663 aa21.46■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 EDEM1Q92611 657 aa21.46■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 SPATA17Q96L03 361 aa21.46■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 RAD9AQ99638 391 aa21.46■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 HERPUD2Q9BSE4 406 aa21.46■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 CALN1Q9BXU9 219 aa21.46■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 FAM204AQ9H8W3 233 aa21.46■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 SCML2Q9UQR0 700 aa21.46■■□□□ 1.03
CTU2-208ENST00000566637 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa21.45■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 ENDOD1O94919 500 aa21.45■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 VNN2O95498 520 aa21.45■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 FNTAP49354 379 aa21.45■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 CREMQ03060 361 aa21.45■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 DUSP4Q13115 394 aa21.45■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 NME3Q13232 169 aa21.45■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 BRD3Q15059 726 aa21.45■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa21.45■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 RFX6Q8HWS3 928 aa21.45■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa21.45■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 ADAM33Q9BZ11 813 aa21.45■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 ABCC13Q9NSE7 274 aa21.45■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa21.45■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 COMMD8Q9NX08 183 aa21.45■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 COX16Q9P0S2 106 aa21.45■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 AMACRQ9UHK6 382 aa21.45■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 TLL1O43897 1013 aa21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 ERLIN1O75477 346 aa21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 FGF18O76093 207 aa21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 F9P00740 461 aa21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 TUFMP49411 452 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 DR1Q01658 176 aa21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 TAZQ16635 292 aa21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 TPGS2Q68CL5 300 aa21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
CTU2-208ENST00000566637 BNIPLQ7Z465 357 aa21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms