RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GABRDO14764 452 aa22.2■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DAB1O75553 588 aa22.2■■□□□ 1.14
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CYP2F1P24903 491 aa22.2■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 L1CAMP32004 1257 aa22.2■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MATKP42679 507 aa22.2■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IFNAR2P48551 515 aa22.2■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NR2C2P49116 596 aa22.2■■□□□ 1.14
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PALM2Q8IXS6 379 aa22.2■■□□□ 1.14
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ANKS4BQ8N8V4 417 aa22.2■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC197Q8NCU1 140 aa22.2■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PPM1EQ8WY54 764 aa22.2■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AP4E1Q9UPM8 1137 aa22.2■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HEY1Q9Y5J3 304 aa22.2■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa22.2■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KCNN4O15554 427 aa22.2■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TMEM63AO94886 807 aa22.2■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NPR3P17342 541 aa22.2■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GCAP28676 217 aa22.2■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TKTP29401 623 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LHX1P48742 406 aa22.2■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NKX3-2P78367 333 aa22.2■■□□□ 1.14
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KCNJ11Q14654 390 aa22.2■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CXCL17Q6UXB2 119 aa22.2■■□□□ 1.14
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LRRC34Q8IZ02 419 aa22.2■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ANKRD42Q8N9B4 389 aa22.2■■□□□ 1.14
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SGSM3Q96HU1 749 aa22.2■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZFP42Q96MM3 310 aa22.2■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RASSF4Q9H2L5 321 aa22.2■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GIT1Q9Y2X7 761 aa22.2■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GPR182O15218 404 aa22.19■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CA12O43570 354 aa22.19■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 THP07101 528 aa22.19■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RARBP10826 455 aa22.19■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CREB1P16220 341 aa22.19■■□□□ 1.14
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GPX6P59796 221 aa22.19■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC25A52Q3SY17 297 aa22.19■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BBS9Q3SYG4 887 aa22.19■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 WSCD1Q658N2 575 aa22.19■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC121Q6ZUS5 278 aa22.19■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SERINC5Q86VE9 423 aa22.19■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FBXO36Q8NEA4 188 aa22.19■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CKAP2Q8WWK9 683 aa22.19■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MED10Q9BTT4 135 aa22.19■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KLC2Q9H0B6 622 aa22.19■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CLUHO75153 1309 aa22.19■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FAM47DPA6NHR8 397 aa22.18■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ANKRD65E5RJM6 399 aa22.18■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SPAG6O75602 509 aa22.18■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ITIH4Q14624 930 aa22.18■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MSS51Q4VC12 460 aa22.18■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PIGWQ7Z7B1 504 aa22.18■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TAX1BP1Q86VP1 789 aa22.18■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SENP8Q96LD8 212 aa22.18■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ACSS3Q9H6R3 686 aa22.18■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LRRC4Q9HBW1 653 aa22.18■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RABGEF1Q9UJ41 708 aa22.18■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRIM66O15016 1216 aa22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KRT15P19012 456 aa22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CTGFP29279 349 aa22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 STX2P32856 288 aa22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SULT1E1P49888 294 aa22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GAD2Q05329 585 aa22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CAPN12Q6ZSI9 719 aa22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRABDQ9H4I3 376 aa22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RAB6BQ9NRW1 208 aa22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 STAP1Q9ULZ2 295 aa22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
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