RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561438.5

TMOD3-211, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD3, Length 1,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-211ENST00000561438 DSEQ9UL01 958 aa8.77□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 YIPF1Q9Y548 306 aa8.77□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa8.77□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 MTCH2Q9Y6C9 303 aa8.77□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 CHD5Q8TDI0 1954 aa8.77□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 A0A0C4DFX4 3053 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 OR6C75A6NL08 312 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 TMCO5BA8MYB1 307 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 E5RJQ4 531 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 FANCGO15287 622 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 LCA5LO95447 670 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 PCSK1P29120 753 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 NRIP1P48552 1158 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 PDE6CP51160 858 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 KIF11P52732 1056 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 MAP3K7CLP57077 242 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 CDK17Q00537 523 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 PDCLQ13371 301 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 CNGA2Q16280 664 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 DUSP6Q16828 381 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 CFAP221Q4G0U5 840 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 ALKBH2Q6NS38 261 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 HFE2Q6ZVN8 426 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 TMEM150AQ86TG1 271 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 PIGZQ86VD9 579 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 METTL23Q86XA0 190 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 TMC8Q8IU68 726 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 MYLIPQ8WY64 445 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 SAMD11Q96NU1 681 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 DUSP16Q9BY84 665 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 LACRTQ9GZZ8 138 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 NEUROD4Q9HD90 331 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 OSER1Q9NX31 292 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 NAGPAQ9UK23 515 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 COG5Q9UP83 839 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 RWDD3Q9Y3V2 267 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP8.76□□□□□ -1.015e-6■■■□□ 14.7
TMOD3-211ENST00000561438 MYO10Q9HD67 2058 aa8.76□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 MOSPD3O75425 235 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 FYNP06241 537 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 ATF2P15336 505 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 PAX3P23760 479 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 MSX1P28360 303 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 CA8P35219 290 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 CCR2P41597 374 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 ARHGAP25P42331 645 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 NTHL1P78549 312 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 OGDHQ02218 1023 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 KRT17Q04695 432 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 ADIGQ0VDE8 80 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 CCDC173Q0VFZ6 552 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 COL19A1Q14993 1142 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 RAB41Q5JT25 222 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 KIAA1841Q6NSI8 718 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 GPR65Q8IYL9 337 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 TCEAL8Q8IYN2 117 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 ANKRD52Q8NB46 1076 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 JOSD2Q8TAC2 188 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF461Q8TAF7 563 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 SLC7A14Q8TBB6 771 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 GIPC2Q8TF65 315 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 IFT43Q96FT9 208 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 ISCUQ9H1K1 167 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 NMUR1Q9HB89 426 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 MAN1C1Q9NR34 630 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 CLEC1BQ9P126 229 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 INSL5Q9Y5Q6 135 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 DUSP10Q9Y6W6 482 aa8.75□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 SHROOM3Q8TF72 1996 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 H7C4K7 107 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-211ENST00000561438 NDUFA10O95299 355 aa8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms