RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 TPM3P06753 285 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 RPS9P46781 194 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 PPP2R5DQ14738 602 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 DGKKQ5KSL6 1271 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 GJB7Q6PEY0 223 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 GPIHBP1Q8IV16 184 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 SYNPOQ8N3V7 929 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 FUCA2Q9BTY2 467 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 ULBP1Q9BZM6 244 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 RNF38Q9H0F5 515 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 LHX5Q9H2C1 402 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 ST7Q9NRC1 585 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM51Q9NW97 253 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 CFAP97Q9P2B7 532 aa16.57■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM170BA6NMN3 283 aa16.56■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 LCP1P13796 627 aa16.56■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 COL9A1P20849 921 aa16.56■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 CTHP32929 405 aa16.56■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 GPD2P43304 727 aa16.56■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 PTPN5P54829 565 aa16.56■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 NUDT18Q6ZVK8 323 aa16.56■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa16.56■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 CCDC105Q8IYK2 499 aa16.56■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 LRRC3BQ96PB8 259 aa16.56■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 EBF3Q9H4W6 596 aa16.56■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 ECT2Q9H8V3 914 aa16.56■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 SMPD4Q9NXE4 827 aa16.56■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 FHOD1Q9Y613 1164 aa16.56■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 F5P12259 2224 aa16.55■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 F8VZ95 297 aa16.55■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 SERPINC1P01008 464 aa16.55■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 STAT1P42224 750 aa16.55■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 RPL34P49207 117 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 DAOAP59103 153 aa16.55■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP16.55■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 SYCP1Q15431 976 aa16.55■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 EML3Q32P44 896 aa16.55■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 PMF1Q6P1K2 205 aa16.55■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 HTR3DQ70Z44 454 aa16.55■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 BEND5Q7L4P6 421 aa16.55■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa16.55■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM35BQ8NCS4 154 aa16.55■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 PLD4Q96BZ4 506 aa16.55■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 IQCDQ96DY2 449 aa16.55■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 ZFYVE19Q96K21 471 aa16.55■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 SYNCQ9H7C4 482 aa16.55■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 NMUR1Q9HB89 426 aa16.55■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 GTSE1Q9NYZ3 720 aa16.55■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 RASAL2Q9UJF2 1139 aa16.55■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 LSM8O95777 96 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 LTFP02788 710 aa16.54■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 DRD1P21728 446 aa16.54■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 CHKAP35790 457 aa16.54■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 RGS7P49802 495 aa16.54■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF445P59923 1031 aa16.54■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 PDCLQ13371 301 aa16.54■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 FBXO43Q4G163 708 aa16.54■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 BSPRYQ5W0U4 402 aa16.54■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa16.54■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 SCD5Q86SK9 330 aa16.54■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC4A5Q9BY07 1137 aa16.54■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 GANQ9H2C0 597 aa16.54■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 HPS4Q9NQG7 708 aa16.54■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 MARCH2Q9P0N8 246 aa16.54■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 MYO6Q9UM54 1294 aa16.54■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 SIK3Q9Y2K2 1263 aa16.54■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 WNT6Q9Y6F9 365 aa16.54■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 A0A1W2PQC6 194 aa16.53■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 TULP2O00295 520 aa16.53■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 CAPN9O14815 690 aa16.53■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 GLI1P08151 1106 aa16.53■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 CYP11B1P15538 503 aa16.53■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 CLCN1P35523 988 aa16.53■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 SOX5P35711 763 aa16.53■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 HARS2P49590 506 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 VCPP55072 806 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 GAD2Q05329 585 aa16.53■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 TNK2Q07912 1038 aa16.53■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 EFEMP1Q12805 493 aa16.53■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 MTA1Q13330 715 aa16.53■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 IQCB1Q15051 598 aa16.53■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 EFHC1Q5JVL4 640 aa16.53■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa16.53■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 TRIM72Q6ZMU5 477 aa16.53■□□□□ 0.24
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM110Q86TL2 294 aa16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms