RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557403.5

RBM23-229, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 826 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-229	ENST00000557403		Q6ZNB5	142 aa		9.64	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		9.64	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		9.64	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		9.64	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	EXOC4	Q96A65	974 aa		9.64	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	NT5C1B	Q96P26	610 aa		9.64	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	9.64	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	DUSP16	Q9BY84	665 aa		9.64	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	9.64	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		9.64	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	SCML2	Q9UQR0	700 aa		9.64	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		9.64	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403		A0A1W2PQH9	124 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	E2F8	A0AVK6	867 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403		K7ESF4	209 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	MDM4	O15151	490 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	LILRB5	O75023	590 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	TBX18	O95935	607 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	CD19	P15391	556 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	DRD1	P21728	446 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	HOXC13	P31276	330 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	FNTB	P49356	437 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	KIF11	P52732	1056 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	NRL	P54845	237 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	CETN1	Q12798	172 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	DHCR24	Q15392	516 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	SGO2	Q562F6	1265 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	NELL1	Q92832	810 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	KAT5	Q92993	513 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	WBP2	Q969T9	261 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	NMUR1	Q9HB89	426 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	OSER1	Q9NX31	292 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	NAGPA	Q9UK23	515 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		9.63	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	9.63	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	TULP2	O00295	520 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	GNA14	O95837	355 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	ADH1C	P00326	375 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	CCDC192	P0DO97	292 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	ADH5	P11766	374 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	RARG	P13631	454 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	FECH	P22830	423 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	OPRD1	P41143	372 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	BCAT1	P54687	386 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	SEC13	P55735	322 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	SLC8A3	P57103	927 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	KDSR	Q06136	332 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	KCNH2	Q12809	1159 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	LPAL2	Q16609	132 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	GAB4	Q2WGN9	574 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	FBXO43	Q4G163	708 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	TMEM270	Q6UE05	265 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	PIGZ	Q86VD9	579 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	TTC30A	Q86WT1	665 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	UBR7	Q8N806	425 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	EPC1	Q9H2F5	836 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	CYLD	Q9NQC7	956 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	NCDN	Q9UBB6	729 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	HESX1	Q9UBX0	185 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	ZNF292	O60281	2723 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		9.62	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		9.61	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	EML5	Q05BV3	1969 aa		9.61	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
RBM23-229	ENST00000557403	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87

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