RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557266.5

RCCD1-208, Transcript of RCC1 domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RCCD1, Length 2,110 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1-208ENST00000557266 ZBED1O96006 694 aa23.49■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 DHRS4L1P0CG22 281 aa23.49■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 MAP2K2P36507 400 aa23.49■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 ETV4P43268 484 aa23.49■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 SLC18A2Q05940 514 aa23.49■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 GRIK4Q16099 956 aa23.49■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 ACCSLQ4AC99 568 aa23.49■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 FYB2Q5VWT5 728 aa23.49■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 NLRP9Q7RTR0 991 aa23.49■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 SESTD1Q86VW0 696 aa23.49■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 CFAP36Q96G28 342 aa23.49■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 APOPT1Q96IL0 206 aa23.49■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 B3GNT5Q9BYG0 378 aa23.49■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 PLAC1Q9HBJ0 212 aa23.49■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 POPDC2Q9HBU9 364 aa23.49■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 PNPLA8Q9NP80 782 aa23.49■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 KANSL3Q9P2N6 904 aa23.49■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 MDM4O15151 490 aa23.48■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 SLC45A4Q5BKX6 768 aa23.48■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 ZNF670Q9BS34 389 aa23.48■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 EBF2Q9HAK2 575 aa23.48■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 ETNK2Q9NVF9 386 aa23.48■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa23.48■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 CITO14578 2027 aa23.48■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 SETSIPP0DME0 302 aa23.48■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 MAGEA6P43360 314 aa23.48■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 OVGP1Q12889 678 aa23.48■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 KIZQ2M2Z5 673 aa23.48■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 ZNF398Q8TD17 642 aa23.48■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 LPIN3Q9BQK8 851 aa23.48■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 YY1AP1Q9H869 796 aa23.48■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 SNTG2Q9NY99 539 aa23.48■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 NUMBLQ9Y6R0 609 aa23.48■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 FAM155BO75949 473 aa23.47■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 PYGBP11216 843 aa23.47■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 PARP6Q2NL67 630 aa23.47■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa23.47■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 ZNF410Q86VK4 478 aa23.47■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa23.47■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 RFWD2Q8NHY2 731 aa23.47■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 SNX27Q96L92 541 aa23.47■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 KLC2Q9H0B6 622 aa23.47■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 SCN1AP35498 2009 aa23.47■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 CBX6O95503 412 aa23.47■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 SLC26A11Q86WA9 606 aa23.47■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 CHSY1Q86X52 802 aa23.47■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 CCDC110Q8TBZ0 833 aa23.47■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 FAM111AQ96PZ2 611 aa23.47■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 NCAPGQ9BPX3 1015 aa23.47■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa23.47■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 RRAGCQ9HB90 399 aa23.47■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 DERAQ9Y315 318 aa23.47■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 HCRTO43612 131 aa23.46■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 APRTP07741 180 aa23.46■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 CCND1P24385 295 aa23.46■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 SNAPC2Q13487 334 aa23.46■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 SPDYAQ5MJ70 313 aa23.46■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 ZNF449Q6P9G9 518 aa23.46■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 CLEC4CQ8WTT0 213 aa23.46■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 INPP5DQ92835 1189 aa23.46■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 DPEP3Q9H4B8 488 aa23.46■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa23.46■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 HESX1Q9UBX0 185 aa23.46■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 DCTN4Q9UJW0 460 aa23.46■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 CYP2F1P24903 491 aa23.45■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 ZBTB6Q15916 424 aa23.45■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 LRRC6Q86X45 466 aa23.45■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 ZFP69BQ9UJL9 534 aa23.45■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 HES2Q9Y543 173 aa23.45■■□□□ 1.35
RCCD1-208ENST00000557266 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
RCCD1-208ENST00000557266 TMEM62Q0P6H9 643 aa23.45■■□□□ 1.34
RCCD1-208ENST00000557266 PPM1NQ8N819 430 aa23.45■■□□□ 1.34
RCCD1-208ENST00000557266 STK32AQ8WU08 396 aa23.45■■□□□ 1.34
RCCD1-208ENST00000557266 ADAMTS10Q9H324 1103 aa23.45■■□□□ 1.34
RCCD1-208ENST00000557266 GJD2Q9UKL4 321 aa23.45■■□□□ 1.34
RCCD1-208ENST00000557266 GINS2Q9Y248 185 aa23.45■■□□□ 1.34
RCCD1-208ENST00000557266 ZNF487B1APH4 448 aa23.44■■□□□ 1.34
RCCD1-208ENST00000557266 ANP32DO95626 131 aa23.44■■□□□ 1.34
RCCD1-208ENST00000557266 PRKCHP24723 683 aa23.44■■□□□ 1.34
RCCD1-208ENST00000557266 L1CAMP32004 1257 aa23.44■■□□□ 1.34
RCCD1-208ENST00000557266 GBE1Q04446 702 aa23.44■■□□□ 1.34
RCCD1-208ENST00000557266 DPYSL2Q16555 572 aa23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms