RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556787.5

PAPOLA-222, Transcript of poly(A) polymerase alpha, human

TSL 2

Gene PAPOLA, Length 806 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	C1QL1	O75973	258 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	RNF8	O76064	485 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	ADRA1D	P25100	572 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	NEK3	P51956	506 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMEM65	Q6PI78	240 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	SRL	Q86TD4	932 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	5.78	□□□□□ -1.48	2e-7	■□□□□ 10.3
PAPOLA-222	ENST00000556787	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	LINC01548	A6NM66	108 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMEM232	C9JQI7	657 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF213	O14771	459 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	MT-CO3	P00414	261 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	VIP	P01282	170 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	YY1	P25490	414 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	TM4SF4	P48230	202 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	MAP9	Q49MG5	647 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF575	Q86XF7	245 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	RNF152	Q8N8N0	203 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	USP29	Q9HBJ7	922 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	COL15A1	P39059	1388 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	AOX1	Q06278	1338 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	KCNQ3	O43525	872 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	WDR47	O94967	919 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	MMP8	P22894	467 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	NTSR1	P30989	418 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC5A2	P31639	672 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	C21orf58	P58505	322 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	LMAN2	Q12907	356 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAM187B	Q17R55	369 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	CCDC142	Q17RM4	750 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	USP49	Q70CQ1	688 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	MMS19	Q96T76	1030 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	CA14	Q9ULX7	337 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	TTC34	A8MYJ7	566 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRRT4	C9JH25	899 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	USP12	O75317	370 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	TEC	P42680	631 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	GSTM5	P46439	218 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	DIO1	P49895	249 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	RENBP	P51606	427 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	CFHR3	Q02985	330 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	5.75	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	PMS2P11	Q13670	270 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	5.75	□□□□□ -1.49	3e-6	■■■■□ 20.4
PAPOLA-222	ENST00000556787	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	PROSER3	Q2NL68	480 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	GJA10	Q969M2	543 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	REPS1	Q96D71	796 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	RGL1	Q9NZL6	768 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	VPS51	Q9UID3	782 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	PODXL	O00592	558 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	SPRY2	O43597	315 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	CDK4	P11802	303 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	FPR3	P25089	353 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	P3H1	Q32P28	736 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PAPOLA-222	ENST00000556787	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49

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