RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555569.1

PCNX4-209, Transcript of pecanex 4, humanhuman

TSL 3

Gene PCNX4, Length 515 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4-209ENST00000555569 SPHK2Q9NRA0 654 aa14.55□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa14.54□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 KAT7O95251 611 aa14.54□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 GRIA2P42262 883 aa14.54□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 PSEN1P49768 467 aa14.54□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 ARHGAP8P85298 464 aa14.54□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 KDSRQ06136 332 aa14.54□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 MESP2Q0VG99 397 aa14.54□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 CUL2Q13617 745 aa14.54□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 CCDC40Q4G0X9 1142 aa14.54□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 C10orf120Q5SQS8 335 aa14.54□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 KLHL10Q6JEL2 608 aa14.54□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 KLHDC10Q6PID8 442 aa14.54□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 HTR3DQ70Z44 454 aa14.54□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 SCD5Q86SK9 330 aa14.54□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 TADA2BQ86TJ2 420 aa14.54□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 SFTPA1Q8IWL2 248 aa14.54□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 TSTD1Q8NFU3 115 aa14.54□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 UBXN6Q9BZV1 441 aa14.54□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 DLL3Q9NYJ7 618 aa14.54□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 EBF1Q9UH73 591 aa14.54□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 DNMT3LQ9UJW3 386 aa14.54□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 NAGPAQ9UK23 515 aa14.54□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 NUDT5Q9UKK9 219 aa14.54□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 MMP17Q9ULZ9 603 aa14.54□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 USP3Q9Y6I4 520 aa14.54□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 ABCA7Q8IZY2 2146 aa14.53□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 A0A0A0MRY4 1105 aa14.53□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 ANTXRLA6NF34 631 aa14.53□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 MDM4O15151 490 aa14.53□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 GREM1O60565 184 aa14.53□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 RALAP11233 206 aa14.53□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 SDHBP21912 280 aa14.53□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 BMP6P22004 513 aa14.53□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 TNFRSF4P43489 277 aa14.53□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 PLA2G4AP47712 749 aa14.53□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 FMO5P49326 533 aa14.53□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 SLC8A3P57103 927 aa14.53□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 LRMPQ12912 555 aa14.53□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 MORC3Q14149 939 aa14.53□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 ANO4Q32M45 955 aa14.53□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 TTI2Q6NXR4 508 aa14.53□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa14.53□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 KBTBD6Q86V97 674 aa14.53□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 TMEM25Q86YD3 366 aa14.53□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa14.53□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 ZNF276Q8N554 614 aa14.53□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 CCDC33Q8N5R6 958 aa14.53□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 NAT16Q8N8M0 369 aa14.53□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 ANKRD52Q8NB46 1076 aa14.53□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 NELFBQ8WX92 580 aa14.53□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 LOXL4Q96JB6 756 aa14.53□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 SEMA4GQ9NTN9 838 aa14.53□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 CTNND2Q9UQB3 1225 aa14.53□□□□□ -0.08
PCNX4-209ENST00000555569 BICDL2A1A5D9 508 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 BIN1O00499 593 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 PMM2O15305 246 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 TULP3O75386 442 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 TIE1P35590 1138 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 DGKEP52429 567 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 CSRP2Q16527 193 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 SGO2Q562F6 1265 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 RAB41Q5JT25 222 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 FOXR2Q6PJQ5 311 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 PIGZQ86VD9 579 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 TTC30AQ86WT1 665 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 ARHGAP18Q8N392 663 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 PHTF2Q8N3S3 785 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 CLIC5Q9NZA1 410 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 DEC1Q9P2X7 70 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 THADAQ6YHU6 1953 aa14.52□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 SPTBN2O15020 2390 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 TBC1D3BA6NDS4 549 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 ABCB7O75027 752 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 EPN2O95208 641 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 CD19P15391 556 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 BCAT1P54687 386 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 CRY1Q16526 586 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 PLK5Q496M5 336 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 EMC10Q5UCC4 262 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 PRR23CQ6ZRP0 262 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 NUDT18Q6ZVK8 323 aa14.51□□□□□ -0.09
PCNX4-209ENST00000555569 ALLCQ8N6M5 410 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms