RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPDYCQ5MJ68 293 aa20.52■□□□□ 0.88
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NUDT18Q6ZVK8 323 aa20.52■□□□□ 0.88
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ACOT1Q86TX2 421 aa20.52■□□□□ 0.88
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa20.52■□□□□ 0.88
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FUKQ8N0W3 1084 aa20.52■□□□□ 0.88
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CRYBG2Q8N1P7 616 aa20.52■□□□□ 0.88
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PHTF2Q8N3S3 785 aa20.52■□□□□ 0.88
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PIGKQ92643 395 aa20.52■□□□□ 0.88
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SDCBP2Q9H190 292 aa20.52■□□□□ 0.88
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCSER2Q9H7U1 834 aa20.52■□□□□ 0.88
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DEC1Q9P2X7 70 aa20.52■□□□□ 0.88
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAN1B1Q9UKM7 699 aa20.52■□□□□ 0.88
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.51■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PSMA7O14818 248 aa20.51■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CETN3O15182 167 aa20.51■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADAM23O75077 832 aa20.51■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 VNN1O95497 513 aa20.51■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BMP6P22004 513 aa20.51■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IRX4P78413 519 aa20.51■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KDSRQ06136 332 aa20.51■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADAM9Q13443 819 aa20.51■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZCWPW2Q504Y3 356 aa20.51■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa20.51■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BBS7Q8IWZ6 715 aa20.51■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM186BQ8IYM0 893 aa20.51■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RLN3Q8WXF3 142 aa20.51■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TAF4BQ92750 862 aa20.51■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NACA2Q9H009 215 aa20.51■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CLSTN2Q9H4D0 955 aa20.51■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FBXO44Q9H4M3 255 aa20.51■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPHK2Q9NRA0 654 aa20.51■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GMIPQ9P107 970 aa20.51■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KIAA1468Q9P260 1216 aa20.51■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 THADAQ6YHU6 1953 aa20.5■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa20.5■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FRYQ5TBA9 3013 aa20.5■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PATE3B3GLJ2 98 aa20.5■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IKBKBO14920 756 aa20.5■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TULP3O75386 442 aa20.5■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EPB41P11171 864 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 VAMP7P51809 220 aa20.5■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ENPEPQ07075 957 aa20.5■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MORC3Q14149 939 aa20.5■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAP7D1Q3KQU3 841 aa20.5■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZACNQ401N2 412 aa20.5■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UNC93AQ86WB7 457 aa20.5■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM25Q86YD3 366 aa20.5■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NAT16Q8N8M0 369 aa20.5■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMOQ99835 787 aa20.5■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa20.5■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRT82Q9NSB4 513 aa20.5■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa20.49■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STX10O60499 249 aa20.49■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DPP6P42658 865 aa20.49■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRCPP42785 496 aa20.49■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LMAN2Q12907 356 aa20.49■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CAMK4Q16566 473 aa20.49■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANO4Q32M45 955 aa20.49■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa20.49■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HTR3DQ70Z44 454 aa20.49■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SYT12Q8IV01 421 aa20.49■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEFF1Q8IYR6 380 aa20.49■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PGBD3Q8N328 593 aa20.49■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCDC150Q8NCX0 1101 aa20.49■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZMIZ2Q8NF64 920 aa20.49■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC2A14Q8TDB8 520 aa20.49■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HMGB4Q8WW32 186 aa20.49■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ELMO3Q96BJ8 720 aa20.49■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IMPG2Q9BZV3 1241 aa20.49■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STARD13Q9Y3M8 1113 aa20.49■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZFHX4Q86UP3 3567 aa20.49■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NUP205Q92621 2012 aa20.49■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYOFQ9NZM1 2061 aa20.49■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa20.48■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GIPC1O14908 333 aa20.48■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TLR5O60602 858 aa20.48■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BEST1O76090 585 aa20.48■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CEACAM1P13688 526 aa20.48■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCDC130P13994 396 aa20.48■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NDST1P52848 882 aa20.48■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAP3K7CLP57077 242 aa20.48■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DLG4P78352 724 aa20.48■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LRRC63Q05C16 580 aa20.48■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SV2AQ7L0J3 742 aa20.48■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FRMD1Q8N878 549 aa20.48■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WBP2Q969T9 261 aa20.48■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms