RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552180.5

GPN3-210, Transcript of GPN-loop GTPase 3, humanhuman

TSL 3

Gene GPN3, Length 640 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3-210ENST00000552180 TMEM196Q5HYL7 178 aa20.38■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 MAMSTRQ6ZN01 415 aa20.38■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 ZNF606Q8WXB4 792 aa20.38■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa20.38■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 LRRC4Q9HBW1 653 aa20.38■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 USP34Q70CQ2 3546 aa20.37■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 LRRC10BA6NIK2 292 aa20.37■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 NFATC1O95644 943 aa20.37■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 RALAP11233 206 aa20.37■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 ZNF18P17022 549 aa20.37■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 RGS7P49802 495 aa20.37■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 GALK1P51570 392 aa20.37■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 ADIGQ0VDE8 80 aa20.37■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 MTAPQ13126 283 aa20.37■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 GAS6Q14393 721 aa20.37■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 MEA1Q16626 185 aa20.37■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 C10orf120Q5SQS8 335 aa20.37■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa20.37■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 FSTL4Q6MZW2 842 aa20.37■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 DENND1BQ6P3S1 775 aa20.37■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 RHBDF2Q6PJF5 856 aa20.37■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 HTR3DQ70Z44 454 aa20.37■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 ARHGAP18Q8N392 663 aa20.37■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 FAM122AQ96E09 287 aa20.37■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 HSFY1Q96LI6 401 aa20.37■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 NACA2Q9H009 215 aa20.37■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 VPS16Q9H269 839 aa20.37■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 TBC1D14Q9P2M4 693 aa20.37■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 DNMT3LQ9UJW3 386 aa20.37■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 YJEFN3A6XGL0 299 aa20.36■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 E7ENQ6 273 aa20.36■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 CYP17A1P05093 508 aa20.36■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 GNA15P30679 374 aa20.36■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 CLCN1P35523 988 aa20.36■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 DAOAP59103 153 aa20.36■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 AMPD2Q01433 879 aa20.36■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 NR1H3Q13133 447 aa20.36■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 DHCR24Q15392 516 aa20.36■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 KLHL40Q2TBA0 621 aa20.36■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 DGKKQ5KSL6 1271 aa20.36■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 TADA2BQ86TJ2 420 aa20.36■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 FAM71AQ8IYT1 594 aa20.36■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 OTUB2Q96DC9 234 aa20.36■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 FUCA2Q9BTY2 467 aa20.36■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 CNGB3Q9NQW8 809 aa20.36■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa20.36■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 PES1O00541 588 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 MED7O43513 233 aa20.35■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 IRF1P10914 325 aa20.35■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 LCP1P13796 627 aa20.35■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 USP8P40818 1118 aa20.35■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 ANO6Q4KMQ2 910 aa20.35■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 BSPRYQ5W0U4 402 aa20.35■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 BBS7Q8IWZ6 715 aa20.35■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 STK32AQ8WU08 396 aa20.35■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 PHOX2BQ99453 314 aa20.35■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 BPIFA3Q9BQP9 254 aa20.35■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 PLCB1Q9NQ66 1216 aa20.35■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 CYTH4Q9UIA0 394 aa20.35■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 FHOD1Q9Y613 1164 aa20.35■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 THAP12O43422 761 aa20.34■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 OPRD1P41143 372 aa20.34■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 COPB1P53618 953 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 LRRC32Q14392 662 aa20.34■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 Q6ZNB5 142 aa20.34■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa20.34■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 SYNPOQ8N3V7 929 aa20.34■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 WDTC1Q8N5D0 677 aa20.34■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 IRGQQ8WZA9 623 aa20.34■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 P2RY13Q9BPV8 354 aa20.34■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 IER2Q9BTL4 223 aa20.34■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 SLC4A5Q9BY07 1137 aa20.34■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 FAM86C1Q9NVL1 165 aa20.34■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 MYOFQ9NZM1 2061 aa20.34■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 PIK3R2O00459 728 aa20.33■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 STC2O76061 302 aa20.33■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 KLKB1P03952 638 aa20.33■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 SP9P0CG40 484 aa20.33■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 UCHL3P15374 230 aa20.33■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 EFEMP1Q12805 493 aa20.33■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 BTBD8Q5XKL5 378 aa20.33■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 Q6ZS52 159 aa20.33■□□□□ 0.85
GPN3-210ENST00000552180 MIB1Q86YT6 1006 aa20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms