RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 YWHABP31946 246 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 RFC2P35250 354 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CLVS2Q5SYC1 327 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 KDELC1Q6UW63 502 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 RGS9BPQ6ZS82 235 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TXNRD3Q86VQ6 643 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 AFG1LQ8WV93 481 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 AMFRQ9UKV5 643 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SAR1BQ9Y6B6 198 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CCT8L1PA6NM43 557 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 KMOO15229 486 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PAHP00439 452 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CTSHP09668 335 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PTPRAP18433 802 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 HSPA13P48723 471 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PSEN2P49810 448 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CDK17Q00537 523 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 MAN2A1Q16706 1144 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 NAA35Q5VZE5 725 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 RNF149Q8NC42 400 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 GJA10Q969M2 543 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TINF2Q9BSI4 451 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 WBP1LQ9NX94 342 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TJP2Q9UDY2 1190 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 EFR3BQ9Y2G0 817 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 H7C0C1 242 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TNFRSF10AO00220 468 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ADCY6O43306 1168 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PRPSAP2O60256 369 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 HAUS5O94927 633 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ALDH2P05091 517 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 MYBL1P10243 752 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CPA3P15088 417 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CD97P48960 835 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 DSG1Q02413 1049 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PEX6Q13608 980 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 EMC2Q15006 297 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 JADE1Q6IE81 842 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 RASSF3Q86WH2 238 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 BBS7Q8IWZ6 715 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 BORCS5Q969J3 196 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ASIC4Q96FT7 647 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 FUT8Q9BYC5 575 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 GUCA1BQ9UMX6 200 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 DOLKQ9UPQ8 538 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 M0QX08 132 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TK2O00142 265 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 AKAP10O43572 662 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 RASGRP1O95267 797 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ASMTLO95671 621 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 THEGLP0DJG4 465 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 FDPSP14324 419 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SLC9A1P19634 815 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ABCB4P21439 1286 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 RCVRNP35243 200 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ETFBP38117 255 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 OR1G1P47890 313 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 GTF2H3Q13889 308 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 MFSD10Q14728 455 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 STARD3Q14849 445 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PDIA6Q15084 440 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SNAP47Q5SQN1 464 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 OR6B2Q6IFH4 312 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TMC7Q7Z402 723 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ELMOD2Q8IZ81 293 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 HDDC3Q8N4P3 179 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 P2RX5Q93086 422 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SLC4A9Q96Q91 983 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 LPIN3Q9BQK8 851 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 KIFC1Q9BW19 673 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 RNF38Q9H0F5 515 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TLL1O43897 1013 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ECDO95905 644 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PLCG1P19174 1290 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 MAGEA1P43355 309 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 IFNAR2P48551 515 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CCT3P49368 545 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 RAPSNQ13702 412 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
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