RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550724.2

HECTD4-212, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 3

Gene HECTD4, Length 587 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-212ENST00000550724 PSEN1P49768 467 aa15.21■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 BCAT1P54687 386 aa15.21■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 EFEMP1Q12805 493 aa15.21■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 DMC1Q14565 340 aa15.21■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 TPGS1Q6ZTW0 290 aa15.21■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 CCDC186Q7Z3E2 898 aa15.21■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 TMEM25Q86YD3 366 aa15.21■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 ARHGEF19Q8IW93 802 aa15.21■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 SFTPA1Q8IWL2 248 aa15.21■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 TRIM59Q8IWR1 403 aa15.21■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 ARHGAP18Q8N392 663 aa15.21■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 KIAA1958Q8N8K9 716 aa15.21■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 EHBP1Q8NDI1 1231 aa15.21■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 ACDQ96AP0 544 aa15.21■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 ULBP1Q9BZM6 244 aa15.21■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 SPHK2Q9NRA0 654 aa15.21■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 RWDD2AQ9UIY3 292 aa15.21■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 USP18Q9UMW8 372 aa15.21■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 USP3Q9Y6I4 520 aa15.21■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
HECTD4-212ENST00000550724 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 GREB1Q4ZG55 1949 aa15.2■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 DENND4CQ5VZ89 1909 aa15.2■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa15.2■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 PIK3R2O00459 728 aa15.2■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 P4HA2O15460 535 aa15.2■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 KAT7O95251 611 aa15.2■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 KRT5P13647 590 aa15.2■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 LCP1P13796 627 aa15.2■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 TIE1P35590 1138 aa15.2■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 RGS7P49802 495 aa15.2■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP15.2■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 MESP2Q0VG99 397 aa15.2■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 BST2Q10589 180 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 FOXR2Q6PJQ5 311 aa15.2■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 HTR3DQ70Z44 454 aa15.2■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 WDR5BQ86VZ2 330 aa15.2■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa15.2■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 UBR7Q8N806 425 aa15.2■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 CCDC26Q8TAB7 109 aa15.2■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 BHMTQ93088 406 aa15.2■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 OTUB2Q96DC9 234 aa15.2■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 UBXN6Q9BZV1 441 aa15.2■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 CLSTN2Q9H4D0 955 aa15.2■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa15.2■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 KIAA1257Q9ULG3 409 aa15.2■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 TBC1D3BA6NDS4 549 aa15.19■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 M0QYV0 167 aa15.19■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 O00370 1275 aa15.19■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 PMM2O15305 246 aa15.19■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 ZBED1O96006 694 aa15.19■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 BRD2P25440 801 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 CNR2P34972 360 aa15.19■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 GRIA2P42262 883 aa15.19■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 ADIGQ0VDE8 80 aa15.19■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 EMC10Q5UCC4 262 aa15.19■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 SYT13Q7L8C5 426 aa15.19■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 ALLCQ8N6M5 410 aa15.19■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 TSTD1Q8NFU3 115 aa15.19■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 LMO3Q8TAP4 145 aa15.19■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 USP33Q8TEY7 942 aa15.19■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 TFAP2BQ92481 460 aa15.19■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 CRACR2AQ9BSW2 395 aa15.19■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 BBS2Q9BXC9 721 aa15.19■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 CLIC5Q9NZA1 410 aa15.19■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 DEC1Q9P2X7 70 aa15.19■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 STRIP2Q9ULQ0 834 aa15.19■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa15.19■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 VPS13AQ96RL7 3174 aa15.18■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 SLC12A8A0AV02 714 aa15.18■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 AXIN1O15169 862 aa15.18■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 TULP3O75386 442 aa15.18■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 RPP40O75818 363 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 APBB3O95704 486 aa15.18■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 PAEPP09466 180 aa15.18■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 HOXA6P31267 233 aa15.18■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 DGKEP52429 567 aa15.18■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 SPEM2Q0P670 501 aa15.18■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 RAB41Q5JT25 222 aa15.18■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 LAIR1Q6GTX8 287 aa15.18■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 KLHDC10Q6PID8 442 aa15.18■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 CAMKK1Q8N5S9 505 aa15.18■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 MLKLQ8NB16 471 aa15.18■□□□□ 0.02
HECTD4-212ENST00000550724 EDEM1Q92611 657 aa15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms