RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 C2CD4BA6NLJ0 364 aa9.74□□□□□ -0.85
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CS-220ENST00000550700 E7ENQ6 273 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 PROSCO94903 275 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 SPATA31D3P0C874 917 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 PYGBP11216 843 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 NCAM1P13591 858 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 EPCAMP16422 314 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 PCK1P35558 622 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 ADAM15Q13444 863 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 HECTD3Q5T447 861 aa9.74□□□□□ -0.85
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CS-220ENST00000550700 CES5AQ6NT32 575 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 MSANTD2Q6P1R3 559 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa9.74□□□□□ -0.85
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CS-220ENST00000550700 TPCN2Q8NHX9 752 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 SCAMP5Q8TAC9 235 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 GIPC2Q8TF65 315 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
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CS-220ENST00000550700 ARHGEF26Q96DR7 871 aa9.74□□□□□ -0.85
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CS-220ENST00000550700 MCEEQ96PE7 176 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 PRDM12Q9H4Q4 367 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
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CS-220ENST00000550700 JRKLQ9Y4A0 524 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 MTCH2Q9Y6C9 303 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 OBSL1O75147 1896 aa9.73□□□□□ -0.85
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CS-220ENST00000550700 ZNF840PA6NDX5 716 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 RCCD1A6NED2 376 aa9.73□□□□□ -0.85
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CS-220ENST00000550700 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
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CS-220ENST00000550700 TBCBQ99426 244 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 NPY6RQ99463 290 aa9.73□□□□□ -0.85
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CS-220ENST00000550700 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 SMOC2Q9H3U7 446 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP9.73□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 DNMT3LQ9UJW3 386 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 AMFRQ9UKV5 643 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa9.73□□□□□ -0.85
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CS-220ENST00000550700 CCL16O15467 120 aa9.72□□□□□ -0.85
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CS-220ENST00000550700 SPOPO43791 374 aa9.72□□□□□ -0.85
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CS-220ENST00000550700 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
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CS-220ENST00000550700 RARGP13631 454 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-220ENST00000550700 IGFBP4P22692 258 aa9.72□□□□□ -0.85
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