RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 ZBED1O96006 694 aa8.78□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 ITGA8P53708 1063 aa8.78□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 GDF10P55107 478 aa8.78□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 COPS2P61201 443 aa8.78□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 DSC1Q08554 894 aa8.78□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 GPS1Q13098 491 aa8.78□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 DPYSL3Q14195 570 aa8.78□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 DDR2Q16832 855 aa8.78□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 P3H1Q32P28 736 aa8.78□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 CEP85LQ5SZL2 805 aa8.78□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP8.78□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 FAM71DQ8N9W8 422 aa8.78□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 ATAD1Q8NBU5 361 aa8.78□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 P3H4Q92791 437 aa8.78□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 SEMA4AQ9H3S1 761 aa8.78□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 VIPAS39Q9H9C1 493 aa8.78□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 TMEM39AQ9NV64 488 aa8.78□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP8.78□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 C2CD2LO14523 706 aa8.78□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 RBP3P10745 1247 aa8.78□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 ERMARDQ5T6L9 678 aa8.78□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 CCDC89Q8N998 374 aa8.78□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 RSAD2Q8WXG1 361 aa8.78□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 UROC1Q96N76 676 aa8.78□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 RUNDC3BQ96NL0 473 aa8.78□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 POPDC2Q9HBU9 364 aa8.78□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 ANAPC5Q9UJX4 755 aa8.78□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 DSEQ9UL01 958 aa8.78□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 AP4E1Q9UPM8 1137 aa8.78□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 H7C0C1 242 aa8.77□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 TRAPPC3O43617 180 aa8.77□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 IL4RP24394 825 aa8.77□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 ATP5OP48047 213 aa8.77□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 GPR15P49685 360 aa8.77□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 VCPP55072 806 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 DEUP1Q05D60 604 aa8.77□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 IFFO1Q0D2I5 559 aa8.77□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 SLC25A52Q3SY17 297 aa8.77□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 CTXN3Q4LDR2 81 aa8.77□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 BBS12Q6ZW61 710 aa8.77□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 RNF34Q969K3 372 aa8.77□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 ARL8AQ96BM9 186 aa8.77□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 SNF8Q96H20 258 aa8.77□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 PCDH18Q9HCL0 1135 aa8.77□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 PIGVQ9NUD9 493 aa8.77□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 DDIT4Q9NX09 232 aa8.77□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 ADAM28Q9UKQ2 775 aa8.77□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 STAP1Q9ULZ2 295 aa8.77□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.77□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 NR2E3Q9Y5X4 410 aa8.77□□□□□ -1
CS-215ENST00000549143 TLDC2A0PJX2 215 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 MCF2LO15068 1137 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 CSPG5O95196 566 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 ACSL3O95573 720 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 CYP11A1P05108 521 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 FYNP06241 537 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 CPB1P15086 417 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 GOT1P17174 413 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 CHKAP35790 457 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 PTPN9P43378 593 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 SLC11A1P49279 550 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 DRG2P55039 364 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 DAOAP59103 153 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 NNTQ13423 1086 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 IZUMO3Q5VZ72 239 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 FAM171BQ6P995 826 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 CAPN12Q6ZSI9 719 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 UNC45BQ8IWX7 931 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 IQCKQ8N0W5 287 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 SH2D3CQ8N5H7 860 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 TTC9BQ8N6N2 239 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 PCDH19Q8TAB3 1148 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 PIK3R5Q8WYR1 880 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 CASD1Q96PB1 797 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 RNF157Q96PX1 679 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP8.77□□□□□ -1.014e-19■■■■□ 26.4
CS-215ENST00000549143 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 DPYSL4O14531 572 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 TP73O15350 636 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 APOC2P02655 101 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 LTFP02788 710 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 AMPD1P23109 780 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 IVDP26440 423 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 NOS2P35228 1153 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 SLCO1A2P46721 670 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CS-215ENST00000549143 SLC5A3P53794 718 aa8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms