RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547188.1

PRDM4-202, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 3

Gene PRDM4, Length 640 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-202ENST00000547188 CACUL1Q86Y37 369 aa25.03■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 SYT15Q9BQS2 421 aa25.03■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 CRTAC1Q9NQ79 661 aa25.03■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 SNX9Q9Y5X1 595 aa25.03■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa25.02■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 ENC1O14682 589 aa25.02■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 PLCG1P19174 1290 aa25.02■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 LMO2P25791 158 aa25.02■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 WNT7BP56706 349 aa25.02■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 CYP27A1Q02318 531 aa25.02■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 KCNT1Q5JUK3 1230 aa25.02■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 FAM124AQ86V42 546 aa25.02■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 IGSF8Q969P0 613 aa25.02■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 LGMNQ99538 433 aa25.02■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa25.02■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 STON1Q9Y6Q2 735 aa25.02■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 F8VP50 259 aa25.01■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 GABRDO14764 452 aa25.01■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 COCHO43405 550 aa25.01■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 RFPL3O75679 317 aa25.01■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 IRF1P10914 325 aa25.01■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 LHX1P48742 406 aa25.01■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 CSRP3P50461 194 aa25.01■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 COLEC12Q5KU26 742 aa25.01■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa25.01■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 GATAD2AQ86YP4 633 aa25.01■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 RAB34Q9BZG1 259 aa25.01■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 TRIM4Q9C037 500 aa25.01■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 GFRA2O00451 464 aa25■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 OXTRP30559 389 aa25■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 ACTN2P35609 894 aa25■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 SLC12A3P55017 1021 aa25■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 NOP14P78316 857 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 STARD3Q14849 445 aa25■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 IL17AQ16552 155 aa25■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 SOWAHAQ2M3V2 549 aa25■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 ARSHQ5FYA8 562 aa25■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 TMPRSS6Q8IU80 811 aa25■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 C1orf127Q8N9H9 656 aa25■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 BBS2Q9BXC9 721 aa25■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 IKZF4Q9H2S9 585 aa25■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 EHD2Q9NZN4 543 aa25■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 TYRP14679 529 aa24.99■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 TEAD4Q15561 434 aa24.99■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 TBC1D25Q3MII6 688 aa24.99■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 PKDCCQ504Y2 493 aa24.99■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 TPGS1Q6ZTW0 290 aa24.99■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 KCNN1Q92952 543 aa24.99■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 SIPA1Q96FS4 1042 aa24.99■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 SLITRK1Q96PX8 696 aa24.99■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 NUP58Q9BVL2 599 aa24.99■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 TM9SF3Q9HD45 589 aa24.99■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 CKAP5Q14008 2032 aa24.98■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 CACNG3O60359 315 aa24.98■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 PDGFRBP09619 1106 aa24.98■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 CACNA2D1P54289 1103 aa24.98■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 TMPRSS3P57727 454 aa24.98■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 INAVAQ3KP66 663 aa24.98■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa24.98■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 FBXL19Q6PCT2 694 aa24.98■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 MYCT1Q8N699 235 aa24.98■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 TOP6BLQ8N6T0 577 aa24.98■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 TTC9Q92623 222 aa24.98■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 CEP295NLQ96MC4 621 aa24.98■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 GDAP2Q9NXN4 497 aa24.98■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 TRAK2O60296 914 aa24.97■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 KRT19P08727 400 aa24.97■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 PLA2G4BP0C869 781 aa24.97■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 DGKGP49619 791 aa24.97■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 ME3Q16798 604 aa24.97■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa24.97■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 GTF3C6Q969F1 213 aa24.97■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 PCED1BQ96HM7 432 aa24.97■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 REEP2Q9BRK0 252 aa24.97■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 CCSER2Q9H7U1 834 aa24.97■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 TMEM30AQ9NV96 361 aa24.97■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 IL17BQ9UHF5 180 aa24.97■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 CDH9Q9ULB4 789 aa24.97■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 CISD3P0C7P0 127 aa24.96■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 GRIA4P48058 902 aa24.96■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 CXorf38Q8TB03 319 aa24.96■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa24.96■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 BHMTQ93088 406 aa24.96■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 PLXNA2O75051 1894 aa24.96■■□□□ 1.59
PRDM4-202ENST00000547188 IL18RAPO95256 599 aa24.95■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 ACADMP11310 421 aa24.95■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 CTSKP43235 329 aa24.95■■□□□ 1.58
PRDM4-202ENST00000547188 ACADVLP49748 655 aa24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms