RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 PEX5LQ8IYB4 626 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 MREGQ8N565 214 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 CCDC63Q8NA47 563 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 ARRDC4Q8NCT1 418 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 STKLD1Q8NE28 680 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 EXD1Q8NHP7 514 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 FNIP1Q8TF40 1166 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 CCT6BQ92526 530 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 TRIM51Q9BSJ1 452 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 CFHR5Q9BXR6 569 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 RABEP2Q9H5N1 569 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 LRRC19Q9H756 370 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 SYNCQ9H7C4 482 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 CHST12Q9NRB3 414 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 FAM114A2Q9NRY5 505 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 GDAP2Q9NXN4 497 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 TJP2Q9UDY2 1190 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 SRRDQ9UH36 339 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 FAM153AQ9UHL3 310 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 TSPAN16Q9UKR8 245 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 L3MBTL1Q9Y468 752 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 KPNA7A9QM74 516 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 F8VP50 259 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 PODXLO00592 558 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 GPR182O15218 404 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 DAPK3O43293 454 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 HSF2BPO75031 334 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 PFKMP08237 780 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 ACADSP16219 412 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 PSMA2P25787 234 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 HOXD10P28358 340 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 GJC1P36383 396 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 COILP38432 576 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 CETN2P41208 172 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 TAF6P49848 677 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 KLC1Q07866 573 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 INAQ16352 499 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 SOWAHAQ2M3V2 549 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 SV2CQ496J9 727 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 DUPD1Q68J44 220 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 TTC27Q6P3X3 843 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 ACOT1Q86TX2 421 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 SLC15A3Q8IY34 581 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 HACE1Q8IYU2 909 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 C12orf29Q8N999 325 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 OR6B3Q8NGW1 331 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 UBA3Q8TBC4 463 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 CD99L2Q8TCZ2 262 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 AGAP11Q8TF27 550 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 NACC2Q96BF6 587 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 MCRS1Q96EZ8 462 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 ERP44Q9BS26 406 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 HERPUD2Q9BSE4 406 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 MIS12Q9H081 205 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 FAM105AQ9NUU6 356 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 TBCCD1Q9NVR7 557 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 TTLL3Q9Y4R7 772 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 NME7Q9Y5B8 376 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 CENPFP49454 3210 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 A8MXQ7 604 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 PTGESO14684 152 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 SPTLC1O15269 473 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 CABYRO75952 493 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 KRT1P04264 644 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 RALAP11233 206 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 TCF4P15884 667 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 NR1D1P20393 614 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 ATP6V1C1P21283 382 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 SP100P23497 879 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 LRPAP1P30533 357 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 HOXD12P35452 270 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 THPOP40225 353 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 ACADVLP49748 655 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 DRG2P55039 364 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 ARPC4P59998 168 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 LLGL1Q15334 1064 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 TAF11Q15544 211 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 PKDCCQ504Y2 493 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 TTMPQ5BVD1 217 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-204ENST00000546621 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms