RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544547.5

LIMS1-215, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 4,461 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-215ENST00000544547 TASP1Q9H6P5 420 aa14.71□□□□□ -0.05
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LIMS1-215ENST00000544547 NR1H2P55055 460 aa14.71□□□□□ -0.06
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LIMS1-215ENST00000544547 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 DCUN1D1Q96GG9 259 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
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LIMS1-215ENST00000544547 KCNMB3Q9NPA1 279 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMS1-215ENST00000544547 TCF7L2Q9NQB0 619 aa14.68□□□□□ -0.06
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