RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531440.5

RNF170-208, Transcript of ring finger protein 170, human

TSL 4

Gene RNF170, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF170-208	ENST00000531440	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	SIX4	Q9UIU6	781 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	CAPN9	O14815	690 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	NPC1	O15118	1278 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	TNFSF14	O43557	240 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	PPP1R37	O75864	691 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	GART	P22102	1010 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	MCM6	Q14566	821 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	STARD3	Q14849	445 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	NUP93	Q8N1F7	819 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	RAD54L	Q92698	747 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	FBXO32	Q969P5	355 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	NXPE2	Q96DL1	559 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	GPR174	Q9BXC1	333 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	PRORY	Q9H606	182 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	CD93	Q9NPY3	652 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	MARK1	Q9P0L2	795 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	NUMA1	Q14980	2115 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	TRIM24	O15164	1050 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	PDGFRB	P09619	1106 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	FAM163B	P0C2L3	166 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	GRK6	P43250	576 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	PTPRN	Q16849	979 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	SAAL1	Q96ER3	474 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	ACCS	Q96QU6	501 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	STRA6	Q9BX79	667 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	INTS13	Q9NVM9	706 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	RAD54B	Q9Y620	910 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNF170-208	ENST00000531440	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	METTL12	A8MUP2	240 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	PRRT4	C9JH25	899 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	IGLV3-19	P01714	112 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	TNNC2	P02585	160 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	TYR	P14679	529 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	BNC1	Q01954	994 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	E2F5	Q15329	346 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	SURF1	Q15526	300 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	INAVA	Q3KP66	663 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	HTR3D	Q70Z44	454 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	SFR1	Q86XK3	245 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	ZNF843	Q8N446	348 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	BBS2	Q9BXC9	721 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	SNX25	Q9H3E2	840 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	13.77	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	COMMD8	Q9NX08	183 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	KIF3A	Q9Y496	699 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	FAM149A	A5PLN7	773 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	TACC1	O75410	805 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	CDK4	P11802	303 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	HNF1B	P35680	557 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	DGKG	P49619	791 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	FUT11	Q495W5	492 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	MMS19	Q96T76	1030 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	NUP58	Q9BVL2	599 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	NACA2	Q9H009	215 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		13.76	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms