RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SGCE-211ENST00000522045 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa5.84□□□□□ -1.47
SGCE-211ENST00000522045 CLIC1O00299 241 aa5.84□□□□□ -1.47
SGCE-211ENST00000522045 TULP3O75386 442 aa5.84□□□□□ -1.47
SGCE-211ENST00000522045 TOMM40O96008 361 aa5.84□□□□□ -1.47
SGCE-211ENST00000522045 CRYABP02511 175 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
SGCE-211ENST00000522045 HGFP14210 728 aa5.84□□□□□ -1.47
SGCE-211ENST00000522045 TACR3P29371 465 aa5.84□□□□□ -1.47
SGCE-211ENST00000522045 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
SGCE-211ENST00000522045 GATMP50440 423 aa5.84□□□□□ -1.47
SGCE-211ENST00000522045 HSF1Q00613 529 aa5.84□□□□□ -1.47
SGCE-211ENST00000522045 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
SGCE-211ENST00000522045 TPH2Q8IWU9 490 aa5.84□□□□□ -1.47
SGCE-211ENST00000522045 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
SGCE-211ENST00000522045 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
SGCE-211ENST00000522045 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.84□□□□□ -1.47
SGCE-211ENST00000522045 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
SGCE-211ENST00000522045 TRIM43BA6NCK2 446 aa5.83□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 CAPN8A6NHC0 703 aa5.83□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 A8MVJ9 347 aa5.83□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 B4DGG1 531 aa5.83□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 TUSC2O75896 110 aa5.83□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 PIAS2O75928 621 aa5.83□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 CD19P15391 556 aa5.83□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 HTR6P50406 440 aa5.83□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 ITGA8P53708 1063 aa5.83□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 YPEL5P62699 121 aa5.83□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 SLC14A1Q13336 389 aa5.83□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 ARHGEF7Q14155 803 aa5.83□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 COLCA1Q6ZS62 124 aa5.83□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa5.83□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 STK31Q9BXU1 1019 aa5.83□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 FAM234AQ9H0X4 552 aa5.83□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 SACM1LQ9NTJ5 587 aa5.83□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 BICRAQ9NZM4 1560 aa5.83□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 CEP164Q9UPV0 1460 aa5.83□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 AKAP10O43572 662 aa5.82□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 MCM5P33992 734 aa5.82□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 SEMA3AQ14563 771 aa5.82□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 ST3GAL2Q16842 350 aa5.82□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 ZNF750Q32MQ0 723 aa5.82□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 LVRNQ6Q4G3 990 aa5.82□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 OVCH2Q7RTZ1 564 aa5.82□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 PNPLA1Q8N8W4 532 aa5.82□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 ACRBPQ8NEB7 543 aa5.82□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 C22orf23Q9BZE7 217 aa5.82□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 HDAC9Q9UKV0 1011 aa5.82□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 RIMKLBQ9ULI2 386 aa5.82□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 SOGA1O94964 1423 aa5.82□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 USP19O94966 1318 aa5.81□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 MYBP10242 640 aa5.81□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 BRAFP15056 766 aa5.81□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 STIM1Q13586 685 aa5.81□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 SPATA3Q8NHX4 192 aa5.81□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 GPATCH3Q96I76 525 aa5.81□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 VPS50Q96JG6 964 aa5.81□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 TMEM60Q9H2L4 133 aa5.81□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 STK32BQ9NY57 414 aa5.81□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 CPNE7Q9UBL6 633 aa5.81□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 STEAP1Q9UHE8 339 aa5.81□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 AQP7P3A6NL99 342 aa5.8□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 ISM1B1AKI9 464 aa5.8□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 FAM227AF5H4B4 570 aa5.8□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 AGPSO00116 658 aa5.8□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 FYB1O15117 783 aa5.8□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 RFPL1O75677 317 aa5.8□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 ADRA1DP25100 572 aa5.8□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 CPA2P48052 419 aa5.8□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 RAB27AP51159 221 aa5.8□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 DEUP1Q05D60 604 aa5.8□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 STK3Q13188 491 aa5.8□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 MTX1Q13505 466 aa5.8□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 ERV3-1Q14264 604 aa5.8□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 SLC29A2Q14542 456 aa5.8□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 NPY5RQ15761 445 aa5.8□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa5.8□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 SWSAP1Q6NVH7 229 aa5.8□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 SMRP1Q8NCR6 262 aa5.8□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 KAZALD1Q96I82 304 aa5.8□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa5.8□□□□□ -1.48
SGCE-211ENST00000522045 CDH19Q9H159 772 aa5.8□□□□□ -1.48
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