RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517006.1

RNU6-410P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 410, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-410P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-410P-201ENST00000517006 SUN3Q8TAQ9 357 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-410P-201ENST00000517006 TNIP3Q96KP6 325 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-410P-201ENST00000517006 SNX27Q96L92 541 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-410P-201ENST00000517006 SNX18Q96RF0 628 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-410P-201ENST00000517006 CIPCQ9C0C6 399 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-410P-201ENST00000517006 PCDHAC1Q9H158 963 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZBTB26Q9HCK0 441 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-410P-201ENST00000517006 NLRC4Q9NPP4 1024 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-410P-201ENST00000517006 SLC52A1Q9NWF4 448 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-410P-201ENST00000517006 STEAP1Q9UHE8 339 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-410P-201ENST00000517006 AMFRQ9UKV5 643 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-410P-201ENST00000517006 ASAP1Q9ULH1 1129 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
RNU6-410P-201ENST00000517006 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 TISP43B9A030 160 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 H7C1Q1 480 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 PODXLO00592 558 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 DHHO43323 396 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 SNX2O60749 519 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 APEHP13798 732 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 CREB1P16220 341 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 ACOX1Q15067 660 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 ST3GAL2Q16842 350 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 TBC1D25Q3MII6 688 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 TMTC4Q5T4D3 741 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 SUMO4Q6EEV6 95 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 GRHL2Q6ISB3 625 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 MORC1Q86VD1 984 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 TERB1Q8NA31 727 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 HASPINQ8TF76 798 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 DPF1Q92782 380 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 NELL1Q92832 810 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZNF566Q969W8 418 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 RITA1Q96K30 269 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 STK33Q9BYT3 514 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 PTGFRNQ9P2B2 879 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 SMIM22K7EJ46 135 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 OVOL3O00110 214 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 PCDH17O14917 1159 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 TMPRSS11DO60235 418 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 EXOC3O60645 756 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 PLA2G6O60733 806 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 WDR47O94967 919 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 CD19P15391 556 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 ADRA1DP25100 572 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 YY1P25490 414 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 PPM1AP35813 382 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 ATP1A4Q13733 1029 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZNF66Q6ZN08 573 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 KRT73Q86Y46 540 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 CCDC150Q8NCX0 1101 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 KAZALD1Q96I82 304 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 SNX15Q9NRS6 342 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 CDC23Q9UJX2 597 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 PCSK5Q92824 1860 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 CGB1A6NKQ9 187 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 CA12O43570 354 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 COQ9O75208 318 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 PPFIA2O75334 1257 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 LATS1O95835 1130 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 MBPP02686 304 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 TMEM225BP0DP42 221 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 IDEP14735 1019 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 PBX1P40424 430 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 RAB30Q15771 203 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 MAPKAPK3Q16644 382 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 TMEM119Q4V9L6 283 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 COLEC12Q5KU26 742 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 SYCE2Q6PIF2 218 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 PTF1AQ7RTS3 328 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 CHSY1Q86X52 802 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 SPICE1Q8N0Z3 855 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 PNPLA1Q8N8W4 532 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-410P-201ENST00000517006 TTLL2Q9BWV7 592 aa3.88□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.9 ms