RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A0G2JND7	137 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	CFAP69	A5D8W1	941 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	CAPN9	O14815	690 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	GYG2	O15488	501 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM189A1	O60320	539 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	MT-ND3	P03897	115 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	WEE2	P0C1S8	567 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	KCNA2	P16389	499 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	BGN	P21810	368 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	AMPD1	P23109	780 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	IL1R2	P27930	398 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	SSTR1	P30872	391 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	PGM1	P36871	562 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	PEX19	P40855	299 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	MAGEA6	P43360	314 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	CACNA2D1	P54289	1103 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	ACTR3	P61158	418 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	GRM1	Q13255	1194 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	RCN2	Q14257	317 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	KCNJ11	Q14654	390 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	PGM5	Q15124	567 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	KAZN	Q674X7	775 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	STYK1	Q6J9G0	422 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM270	Q6UE05	265 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	FBXO27	Q8NI29	283 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	ACTL9	Q8TC94	416 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	GPRASP2	Q96D09	838 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	BICD1	Q96G01	975 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	C7orf26	Q96N11	449 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	MCEE	Q96PE7	176 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	ZIC5	Q96T25	663 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	VCX	Q9H320	206 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	RUBCNL	Q9H714	662 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	PXMP2	Q9NR77	195 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	ETAA1	Q9NY74	926 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	PDP2	Q9P2J9	529 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	SCOC	Q9UIL1	159 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A1W2PNR3	127 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	WDR91	A4D1P6	747 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	YDJC	A8MPS7	323 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	GOLGA8R	I6L899	631 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	SGK1	O00141	431 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	LPXN	O60711	386 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	SMIM24	O75264	130 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ATXN3-212	ENST00000515746	LRCH4	O75427	683 aa		5.17	□□□□□ -1.58

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