RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515479.5

RUFY3-215, Transcript of RUN and FYVE domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RUFY3, Length 893 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3-215ENST00000515479 GALNT4Q8N4A0 578 aa5.47□□□□□ -1.53
RUFY3-215ENST00000515479 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa5.47□□□□□ -1.53
RUFY3-215ENST00000515479 SNX18Q96RF0 628 aa5.47□□□□□ -1.53
RUFY3-215ENST00000515479 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RUFY3-215ENST00000515479 CIPCQ9C0C6 399 aa5.47□□□□□ -1.53
RUFY3-215ENST00000515479 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RUFY3-215ENST00000515479 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa5.47□□□□□ -1.53
RUFY3-215ENST00000515479 KLHL13Q9P2N7 655 aa5.47□□□□□ -1.53
RUFY3-215ENST00000515479 SNX14Q9Y5W7 946 aa5.47□□□□□ -1.53
RUFY3-215ENST00000515479 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RUFY3-215ENST00000515479 IFT172Q9UG01 1749 aa5.47□□□□□ -1.53
RUFY3-215ENST00000515479 NWD2Q9ULI1 1742 aa5.47□□□□□ -1.53
RUFY3-215ENST00000515479 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa5.47□□□□□ -1.53
RUFY3-215ENST00000515479 NPHP3Q7Z494 1330 aa5.47□□□□□ -1.53
RUFY3-215ENST00000515479 WDR17Q8IZU2 1322 aa5.47□□□□□ -1.53
RUFY3-215ENST00000515479 PARD3Q8TEW0 1356 aa5.46□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 A0A087WWL8 130 aa5.46□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa5.46□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 A0A088AWK7 358 aa5.46□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 UBE2Q2LH0YL09 131 aa5.46□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 AP4M1O00189 453 aa5.46□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 IKBKBO14920 756 aa5.46□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 ABLIM3O94929 683 aa5.46□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 KCNA3P22001 575 aa5.46□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 FPR3P25089 353 aa5.46□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 PLCD1P51178 756 aa5.46□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 RENBPP51606 427 aa5.46□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 DGKEP52429 567 aa5.46□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 CYP1B1Q16678 543 aa5.46□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 LY6KQ17RY6 165 aa5.46□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 DAAM2Q86T65 1068 aa5.46□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa5.46□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 TMEM171Q8WVE6 324 aa5.46□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa5.46□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 TONSLQ96HA7 1378 aa5.45□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 NPR1P16066 1061 aa5.45□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 NCLP19338 710 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 C1QTNF8P60827 252 aa5.45□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 RABEP1Q15276 862 aa5.45□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 PXDC1Q5TGL8 231 aa5.45□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 GAS2L3Q86XJ1 694 aa5.45□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 MPP5Q8N3R9 675 aa5.45□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa5.45□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa5.45□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 PRR25Q96S07 402 aa5.45□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 TRIM54Q9BYV2 358 aa5.45□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 BRINP2Q9C0B6 783 aa5.45□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 NMRK2Q9NPI5 230 aa5.45□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa5.45□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 GLI3P10071 1580 aa5.45□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 MYOM2P54296 1465 aa5.45□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 C1orf167Q5SNV9 1468 aa5.45□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 A0A1W2PPL8 197 aa5.44□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 DISP2A7MBM2 1401 aa5.44□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 H3BML4 177 aa5.44□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 BCAR3O75815 825 aa5.44□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 UBXN7O94888 489 aa5.44□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 HSPA6P17066 643 aa5.44□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 CTBP1Q13363 440 aa5.44□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 MLC1Q15049 377 aa5.44□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 Q4G0T1 1027 aa5.44□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 PLA1AQ53H76 456 aa5.44□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 OR6B3Q8NGW1 331 aa5.44□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 BPIFB1Q8TDL5 484 aa5.44□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 LRGUKQ96M69 825 aa5.44□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 NT5C1BQ96P26 610 aa5.44□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 MMS19Q96T76 1030 aa5.44□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 FAM118BQ9BPY3 351 aa5.44□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa5.44□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 ZSCAN32Q9NX65 697 aa5.44□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 GABBR1Q9UBS5 961 aa5.44□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa5.43□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa5.43□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 PSMD9O00233 223 aa5.43□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 BTN3A1O00481 513 aa5.43□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 ALDH1L1O75891 902 aa5.43□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 KITP10721 976 aa5.43□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 ARFIP2P53365 341 aa5.43□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 KRTAP10-9P60411 292 aa5.43□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa5.43□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 SIRT6Q8N6T7 355 aa5.43□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 PPP1R35Q8TAP8 253 aa5.43□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 PPP2R3CQ969Q6 453 aa5.43□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 HMCESQ96FZ2 354 aa5.43□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 GPATCH3Q96I76 525 aa5.43□□□□□ -1.54
RUFY3-215ENST00000515479 SIN3AQ96ST3 1273 aa5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms