RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514901.5

NUP54-216, Transcript of nucleoporin 54, humanhuman

TSL 3

Gene NUP54, Length 500 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54-216ENST00000514901 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
NUP54-216ENST00000514901 BEND5Q7L4P6 421 aa14.96□□□□□ -0.01
NUP54-216ENST00000514901 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa14.96□□□□□ -0.01
NUP54-216ENST00000514901 SCUBE3Q8IX30 993 aa14.96□□□□□ -0.01
NUP54-216ENST00000514901 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
NUP54-216ENST00000514901 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
NUP54-216ENST00000514901 RNF139Q8WU17 664 aa14.96□□□□□ -0.01
NUP54-216ENST00000514901 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
NUP54-216ENST00000514901 SYNCQ9H7C4 482 aa14.96□□□□□ -0.01
NUP54-216ENST00000514901 CYTH4Q9UIA0 394 aa14.96□□□□□ -0.01
NUP54-216ENST00000514901 FBXL21Q9UKT6 434 aa14.96□□□□□ -0.01
NUP54-216ENST00000514901 CAPN11Q9UMQ6 739 aa14.96□□□□□ -0.01
NUP54-216ENST00000514901 CPQQ9Y646 472 aa14.96□□□□□ -0.01
NUP54-216ENST00000514901 TECTAO75443 2155 aa14.95□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 YJEFN3A6XGL0 299 aa14.95□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 E5RJQ4 531 aa14.95□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 E7ENQ6 273 aa14.95□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 TBX18O95935 607 aa14.95□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 LTFP02788 710 aa14.95□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 GLI1P08151 1106 aa14.95□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 GLULP15104 373 aa14.95□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 COG7P83436 770 aa14.95□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 USP4Q13107 963 aa14.95□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 TRIM14Q14142 442 aa14.95□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 MTF1Q14872 753 aa14.95□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 PDGFRLQ15198 375 aa14.95□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 ASIC2Q16515 512 aa14.95□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 BHLHA9Q7RTU4 235 aa14.95□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa14.95□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 ERICH1Q86X53 443 aa14.95□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 SHDQ96IW2 340 aa14.95□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 CPXM1Q96SM3 734 aa14.95□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 AGPAT1Q99943 283 aa14.95□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa14.95□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 RBSNQ9H1K0 784 aa14.95□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 EPHX3Q9H6B9 360 aa14.95□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 ASNSD1Q9NWL6 643 aa14.95□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 TBC1D14Q9P2M4 693 aa14.95□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 STRIP2Q9ULQ0 834 aa14.95□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 MYO16Q9Y6X6 1858 aa14.95□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 E2F8A0AVK6 867 aa14.94□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 TMEM221A6NGB7 291 aa14.94□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 LRRC53A6NM62 1247 aa14.94□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 M0R296 226 aa14.94□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 PIK3R2O00459 728 aa14.94□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 CHRNB2P17787 502 aa14.94□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 ZBED6P86452 979 aa14.94□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 FMO1Q01740 532 aa14.94□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 PRKCQQ04759 706 aa14.94□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 SLC44A4Q53GD3 710 aa14.94□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 EFHC1Q5JVL4 640 aa14.94□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa14.94□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa14.94□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa14.94□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 SLC20A1Q8WUM9 679 aa14.94□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 OSCP1Q8WVF1 389 aa14.94□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 C18orf8Q96DM3 657 aa14.94□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 FAM83CQ9BQN1 747 aa14.94□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 SMOC2Q9H3U7 446 aa14.94□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 GKN1Q9NS71 199 aa14.94□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 SMPD4Q9NXE4 827 aa14.94□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 MARCH2Q9P0N8 246 aa14.94□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 CFAP97Q9P2B7 532 aa14.94□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa14.94□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 ARNTLO00327 626 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 TPM1P09493 284 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 TNFAIP3P21580 790 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 SCNN1AP37088 669 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 PRKCIP41743 596 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 GABRB2P47870 512 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 IFNAR2P48551 515 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 NOMO3P69849 1222 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 ZXDBP98169 803 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 EFEMP1Q12805 493 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 PTPN20Q4JDL3 420 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 C1orf228Q6PIY5 440 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 VSTM4Q8IW00 320 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 CLEC4CQ8WTT0 213 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 FAM149B1Q96BN6 582 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 OTUB2Q96DC9 234 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 ASIC4Q96FT7 647 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 MSANTD3Q96H12 275 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 TRIM5Q9C035 493 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 POPDC2Q9HBU9 364 aa14.93□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
NUP54-216ENST00000514901 ZNF510Q9Y2H8 683 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms