RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 GFPT2O94808 682 aa11.97□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 F11P03951 625 aa11.97□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 CSH1P0DML2 217 aa11.97□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 CSH2P0DML3 217 aa11.97□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 HOXC13P31276 330 aa11.97□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 CNR2P34972 360 aa11.97□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 NDST1P52848 882 aa11.97□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 RUNX3Q13761 415 aa11.97□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 CCINQ13939 588 aa11.97□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 DDR2Q16832 855 aa11.97□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 TC2NQ8N9U0 490 aa11.97□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa11.97□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM176AQ96HP8 235 aa11.97□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 EBF3Q9H4W6 596 aa11.97□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 TRPC7Q9HCX4 862 aa11.97□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 TDP1Q9NUW8 608 aa11.97□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 ZMYM5Q9UJ78 669 aa11.97□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 GTF3C4Q9UKN8 822 aa11.97□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 FANCMQ8IYD8 2048 aa11.97□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 CYP26A1O43174 497 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 SERPING1P05155 500 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 PDGFRBP09619 1106 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 VDRP11473 427 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 CYP2F1P24903 491 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP11.96□□□□□ -0.491e-6■■□□□ 13.4
UBE2B-208ENST00000511807 CLCN1P35523 988 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 PXNP49023 591 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 PDE6CP51160 858 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 CDK17Q00537 523 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 ARID5AQ03989 594 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 KLHL30Q0D2K2 578 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP11.96□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC142Q17RM4 750 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF394Q53GI3 561 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 PKN3Q6P5Z2 889 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 MON1AQ86VX9 555 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 SCN4BQ8IWT1 228 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 CRYBG2Q8N1P7 616 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 SYNPOQ8N3V7 929 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 FAM83CQ9BQN1 747 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 ACBD6Q9BR61 282 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 RTKNQ9BST9 563 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 KIF9Q9HAQ2 790 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 HPS4Q9NQG7 708 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 SEMA4GQ9NTN9 838 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 CDH9Q9ULB4 789 aa11.96□□□□□ -0.49
UBE2B-208ENST00000511807 TSC2P49815 1807 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 MED7O43513 233 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 HCRTO43612 131 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 ARSAP15289 507 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 CD19P15391 556 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 GNA15P30679 374 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 PRKCIP41743 596 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF132P52740 706 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 RAD23BP54727 409 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 GOLGA8FQ08AF8 430 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 STILQ15468 1287 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM196Q5HYL7 178 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 FSTL4Q6MZW2 842 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 VPS36Q86VN1 386 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 WDR5BQ86VZ2 330 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 OSTM1Q86WC4 334 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF677Q86XU0 584 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 TMTC1Q8IUR5 882 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 SLC4A11Q8NBS3 891 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC112Q8NEF3 446 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 RIN3Q8TB24 985 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 WHAMMQ8TF30 809 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 SYT15Q9BQS2 421 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 ELOVL4Q9GZR5 314 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 PDCL3Q9H2J4 239 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 ABCB6Q9NP58 842 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 SLC8A2Q9UPR5 921 aa11.95□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 CACNA1AO00555 2505 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 DCHS1Q96JQ0 3298 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 THAP12O43422 761 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 LRP3O75074 770 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 ATG13O75143 517 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 TADA3O75528 432 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 CKMP06732 381 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 CYP11B1P15538 503 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 TNFAIP3P21580 790 aa11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms