RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000500401.2

SPCS2P3-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 2 pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene SPCS2P3, Length 656 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS2P3-201ENST00000500401 MYL5Q02045 173 aa25.4■■□□□ 1.66
SPCS2P3-201ENST00000500401 ANO6Q4KMQ2 910 aa25.4■■□□□ 1.66
SPCS2P3-201ENST00000500401 C10orf120Q5SQS8 335 aa25.4■■□□□ 1.66
SPCS2P3-201ENST00000500401 FSTL4Q6MZW2 842 aa25.4■■□□□ 1.66
SPCS2P3-201ENST00000500401 Q6ZS52 159 aa25.4■■□□□ 1.66
SPCS2P3-201ENST00000500401 C1orf210Q8IVY1 113 aa25.4■■□□□ 1.66
SPCS2P3-201ENST00000500401 BBS7Q8IWZ6 715 aa25.4■■□□□ 1.66
SPCS2P3-201ENST00000500401 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa25.4■■□□□ 1.66
SPCS2P3-201ENST00000500401 CPA6Q8N4T0 437 aa25.4■■□□□ 1.66
SPCS2P3-201ENST00000500401 CLEC4CQ8WTT0 213 aa25.4■■□□□ 1.66
SPCS2P3-201ENST00000500401 ZNF606Q8WXB4 792 aa25.4■■□□□ 1.66
SPCS2P3-201ENST00000500401 ATP2A3Q93084 1043 aa25.4■■□□□ 1.66
SPCS2P3-201ENST00000500401 CLIC5Q9NZA1 410 aa25.4■■□□□ 1.66
SPCS2P3-201ENST00000500401 CYTH4Q9UIA0 394 aa25.4■■□□□ 1.66
SPCS2P3-201ENST00000500401 FHOD1Q9Y613 1164 aa25.4■■□□□ 1.66
SPCS2P3-201ENST00000500401 GNA15P30679 374 aa25.39■■□□□ 1.66
SPCS2P3-201ENST00000500401 GPD2P43304 727 aa25.39■■□□□ 1.66
SPCS2P3-201ENST00000500401 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.66
SPCS2P3-201ENST00000500401 MTAPQ13126 283 aa25.39■■□□□ 1.66
SPCS2P3-201ENST00000500401 CCINQ13939 588 aa25.39■■□□□ 1.66
SPCS2P3-201ENST00000500401 STILQ15468 1287 aa25.39■■□□□ 1.66
SPCS2P3-201ENST00000500401 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.66
SPCS2P3-201ENST00000500401 AOPEPQ8N6M6 819 aa25.39■■□□□ 1.66
SPCS2P3-201ENST00000500401 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
SPCS2P3-201ENST00000500401 FUCA2Q9BTY2 467 aa25.39■■□□□ 1.66
SPCS2P3-201ENST00000500401 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
SPCS2P3-201ENST00000500401 CHRDQ9H2X0 955 aa25.39■■□□□ 1.66
SPCS2P3-201ENST00000500401 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
SPCS2P3-201ENST00000500401 ATG2BQ96BY7 2078 aa25.38■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 E2F8A0AVK6 867 aa25.38■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 YJEFN3A6XGL0 299 aa25.38■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 E7ENQ6 273 aa25.38■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 NCAM2O15394 837 aa25.38■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 THAP12O43422 761 aa25.38■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 ZNF18P17022 549 aa25.38■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 PSEN1P49768 467 aa25.38■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 GALK1P51570 392 aa25.38■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 DAOAP59103 153 aa25.38■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 DHCR24Q15392 516 aa25.38■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 TMEM196Q5HYL7 178 aa25.38■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa25.38■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 KLHDC10Q6PID8 442 aa25.38■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 RHBDF2Q6PJF5 856 aa25.38■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 C2orf42Q9NWW7 574 aa25.38■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 RASAL2Q9UJF2 1139 aa25.38■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 DNMT3LQ9UJW3 386 aa25.38■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa25.38■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 MYO15AQ9UKN7 3530 aa25.37■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 ANTXRLA6NF34 631 aa25.37■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 NFATC1O95644 943 aa25.37■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 HOXC13P31276 330 aa25.37■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 CLCN1P35523 988 aa25.37■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 OPRD1P41143 372 aa25.37■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 COPB1P53618 953 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 EFEMP1Q12805 493 aa25.37■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 C1orf228Q6PIY5 440 aa25.37■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 C12orf40Q86WS4 652 aa25.37■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 MIB1Q86YT6 1006 aa25.37■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 ZNF276Q8N554 614 aa25.37■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 KIAA1958Q8N8K9 716 aa25.37■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 FAM81BQ96LP2 452 aa25.37■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 EGFP01133 1207 aa25.36■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 RALAP11233 206 aa25.36■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 ATP1A3P13637 1013 aa25.36■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 MAGEA9P43362 315 aa25.36■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 MESP2Q0VG99 397 aa25.36■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 KLHL40Q2TBA0 621 aa25.36■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 PKN3Q6P5Z2 889 aa25.36■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 TSSK4Q6SA08 328 aa25.36■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa25.36■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 EDEM1Q92611 657 aa25.36■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 CNGB3Q9NQW8 809 aa25.36■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 TJP2Q9UDY2 1190 aa25.36■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 DMDP11532 3685 aa25.35■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 EPHB6O15197 1021 aa25.35■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 STC2O76061 302 aa25.35■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 RPL34P49207 117 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 RAPGEF1Q13905 1077 aa25.35■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 LY6G5CQ5SRR4 150 aa25.35■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 BSPRYQ5W0U4 402 aa25.35■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 HTR3DQ70Z44 454 aa25.35■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 SLC47A2Q86VL8 602 aa25.35■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 SCML4Q8N228 414 aa25.35■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 WDTC1Q8N5D0 677 aa25.35■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 HSFY1Q96LI6 401 aa25.35■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 P2RY13Q9BPV8 354 aa25.35■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 MIS12Q9H081 205 aa25.35■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 GANQ9H2C0 597 aa25.35■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 USP34Q70CQ2 3546 aa25.35■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 KLKB1P03952 638 aa25.34■■□□□ 1.65
SPCS2P3-201ENST00000500401 HMBSP08397 361 aa25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms