RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498219.5

HPS1-214, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 845 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-214ENST00000498219 ADIGQ0VDE8 80 aa15.48■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 FZD5Q13467 585 aa15.48■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 PDGFRLQ15198 375 aa15.48■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 CNGA2Q16280 664 aa15.48■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 EML3Q32P44 896 aa15.48■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 PKDCCQ504Y2 493 aa15.48■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 RAB41Q5JT25 222 aa15.48■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 CCDC186Q7Z3E2 898 aa15.48■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 ZNF687Q8N1G0 1237 aa15.48■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 NEK11Q8NG66 645 aa15.48■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 CHFRQ96EP1 664 aa15.48■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 FAM81BQ96LP2 452 aa15.48■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 UBXN6Q9BZV1 441 aa15.48■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 RBSNQ9H1K0 784 aa15.48■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 FAM86C1Q9NVL1 165 aa15.48■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 IFNKQ9P0W0 207 aa15.48■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 KIAA1257Q9ULG3 409 aa15.48■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 GABBR2O75899 941 aa15.47■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 TCF3P15923 654 aa15.47■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 CLCN1P35523 988 aa15.47■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 SLC8A3P57103 927 aa15.47■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 PMF1Q6P1K2 205 aa15.47■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 DENND1BQ6P3S1 775 aa15.47■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 ECT2Q9H8V3 914 aa15.47■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 LMAN1LQ9HAT1 526 aa15.47■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 LRRC4Q9HBW1 653 aa15.47■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 F8VZ95 297 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 THAP12O43422 761 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 ZBED1O96006 694 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 SETSIPP0DME0 302 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 GNA15P30679 374 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 GJA4P35212 333 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 PLA2G4AP47712 749 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 TUBP50607 506 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 C10orf120Q5SQS8 335 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 BHLHA9Q7RTU4 235 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 SLC47A2Q86VL8 602 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 FAM71AQ8IYT1 594 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 ZNF606Q8WXB4 792 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 PHOX2BQ99453 314 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 STK33Q9BYT3 514 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 OSBPL6Q9BZF3 934 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 CYLDQ9NQC7 956 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-214ENST00000498219 GFPT2O94808 682 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 CHRNB1P11230 501 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 PTPN5P54829 565 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 JAM2P57087 298 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP15.45■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 NHLH1Q02575 133 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 EFEMP1Q12805 493 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 ANGPT1Q15389 498 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 MIB1Q86YT6 1006 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 BBS7Q8IWZ6 715 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 CPA6Q8N4T0 437 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 CLEC4CQ8WTT0 213 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 SLC35F5Q8WV83 523 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 ATP2A3Q93084 1043 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 CLDN23Q96B33 292 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 NELL2Q99435 816 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 KCNH6Q9H252 994 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 RASAL2Q9UJF2 1139 aa15.45■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 FAM170AA1A519 330 aa15.44■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 YJEFN3A6XGL0 299 aa15.44■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 E7ENQ6 273 aa15.44■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 AP5Z1O43299 807 aa15.44■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 NFATC1O95644 943 aa15.44■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 CYP17A1P05093 508 aa15.44■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 HMBSP08397 361 aa15.44■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 RALAP11233 206 aa15.44■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 NUBP1P53384 320 aa15.44■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 STILQ15468 1287 aa15.44■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 PM20D1Q6GTS8 502 aa15.44■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 FSTL4Q6MZW2 842 aa15.44■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 Q6ZS52 159 aa15.44■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP15.44■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 KCTD13Q8WZ19 329 aa15.44■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 EDEM1Q92611 657 aa15.44■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 MSANTD3Q96H12 275 aa15.44■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 PRRX2Q99811 253 aa15.44■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 MIS12Q9H081 205 aa15.44■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 CYTH4Q9UIA0 394 aa15.44■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 A0A1W2PQC6 194 aa15.43■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 E2F8A0AVK6 867 aa15.43■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 NCAM2O15394 837 aa15.43■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 EGFP01133 1207 aa15.43■□□□□ 0.06
HPS1-214ENST00000498219 SOX5P35711 763 aa15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms