RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493083.5

GPBP1L1-211, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1 like 1, human

TSL 2

Gene GPBP1L1, Length 725 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPBP1L1-211	ENST00000493083	SLC29A2	Q14542	456 aa		4	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	SEMA3A	Q14563	771 aa		4	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		4	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		4	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		4	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		4	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	DPH1	Q9BZG8	443 aa		4	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	TRIM5	Q9C035	493 aa		4	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		4	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		4	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		4	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		4	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		4	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		4	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	SYNJ1	O43426	1573 aa		3.99	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		3.99	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	CFAP69	A5D8W1	941 aa		3.99	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	FAM227A	F5H4B4	570 aa		3.99	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	EXOC5	O00471	708 aa		3.99	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	TPH1	P17752	444 aa		3.99	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	ITGA8	P53708	1063 aa		3.99	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	CFHR3	Q02985	330 aa		3.99	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	STK3	Q13188	491 aa		3.99	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	STIM1	Q13586	685 aa		3.99	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	ARHGEF7	Q14155	803 aa		3.99	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		3.99	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		3.99	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	DEF8	Q6ZN54	512 aa		3.99	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	P3H2	Q8IVL5	708 aa		3.99	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	3.99	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		3.99	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		3.99	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	ZNF398	Q8TD17	642 aa		3.99	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		3.99	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	LYZL4	Q96KX0	146 aa		3.99	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	MARK4	Q96L34	752 aa		3.99	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	USP29	Q9HBJ7	922 aa		3.99	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		3.99	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		3.99	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	CLIP1	P30622	1438 aa		3.98	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		3.98	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	ANKRD62	A6NC57	917 aa		3.98	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083		A8MVJ9	347 aa		3.98	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	ISM1	B1AKI9	464 aa		3.98	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083		B4DGG1	531 aa		3.98	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	TMEM233	B4DJY2	109 aa		3.98	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		3.98	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	CLIC1	O00299	241 aa		3.98	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	INPPL1	O15357	1258 aa		3.98	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	TLR2	O60603	784 aa		3.98	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	PSG1	P11464	419 aa		3.98	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	ADRA1D	P25100	572 aa		3.98	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		3.98	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		3.98	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		3.98	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		3.98	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	WASF1	Q92558	559 aa		3.98	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		3.98	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	NLRP4	Q96MN2	994 aa		3.98	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		3.98	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		3.98	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		3.98	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		3.98	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		3.98	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	MAP3K1	Q13233	1512 aa		3.98	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		3.98	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	WDR62	O43379	1518 aa		3.97	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083		H7C4K7	107 aa		3.97	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	RAB27B	O00194	218 aa		3.97	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	CTSA	P10619	480 aa		3.97	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	ACVR2A	P27037	513 aa		3.97	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	CACNB3	P54284	484 aa		3.97	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	EPHB1	P54762	984 aa		3.97	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	3.97	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	AWAT1	Q58HT5	328 aa		3.97	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	NPNT	Q6UXI9	565 aa		3.97	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		3.97	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		3.97	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	IL31RA	Q8NI17	732 aa		3.97	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	NT5C1B	Q96P26	610 aa		3.97	□□□□□ -1.77
GPBP1L1-211	ENST00000493083	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		3.97	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms