RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491090.5

SNX5-215, Transcript of sorting nexin 5, human

TSL 3

Gene SNX5, Length 819 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNX5-215	ENST00000491090	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	ZNF529	Q6P280	563 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	LNX2	Q8N448	690 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	PORCN	Q9H237	461 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	LANCL2	Q9NS86	450 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	CGB1	A6NKQ9	187 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	DNM1L	O00429	736 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	PROP1	O75360	226 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	CYBA	P13498	195 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	PCSK1	P29120	753 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	SLC6A9	P48067	706 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	SPP2	Q13103	211 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	GPR142	Q7Z601	462 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	TRPV1	Q8NER1	839 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	LPAR1	Q92633	364 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	FAM122A	Q96E09	287 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	CACNA1B	Q00975	2339 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNX5-215	ENST00000491090	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	CNMD	O75829	334 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	HOXC6	P09630	235 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	CKB	P12277	381 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	MAPK4	P31152	587 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	RGS2	P41220	211 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	PHKA1	P46020	1223 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	PROK1	P58294	105 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	NOMO3	P69849	1222 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	SEPT2	Q15019	361 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	NOMO1	Q15155	1222 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	GEN1	Q17RS7	908 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090		Q8NA96	180 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	LPIN2	Q92539	896 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	BAD	Q92934	168 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	TTC1	Q99614	292 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	DNAJC18	Q9H819	358 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	VTA1	Q9NP79	307 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	THEG	Q9P2T0	379 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	TECTA	O75443	2155 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	EYA2	O00167	538 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	SLC5A1	P13866	664 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	MCAM	P43121	646 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	BTD	P43251	543 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	PER3	P56645	1201 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	BACE1	P56817	501 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	SLFN5	Q08AF3	891 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	PICALM	Q13492	652 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	GRB14	Q14449	540 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	ANO4	Q32M45	955 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	TRIM60	Q495X7	471 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNX5-215	ENST00000491090	TOR2A	Q5JU69	321 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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