RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487620.1

ZNF3-215, Transcript of zinc finger protein 3, human

TSL 2

Gene ZNF3, Length 2,660 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF3-215	ENST00000487620	FSTL1	Q12841	308 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	KRT81	Q14533	505 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	ZPBP2	Q6X784	338 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	MFN1	Q8IWA4	741 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	CEP120	Q8N960	986 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	MTBP	Q96DY7	904 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	PAK5	Q9P286	719 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	TRIP11	Q15643	1979 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	KRT38	O76015	456 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	ZBED1	O96006	694 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	C1QA	P02745	245 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	HOXC6	P09630	235 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	CSH1	P0DML2	217 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	CSH2	P0DML3	217 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	RBL1	P28749	1068 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	HMGCS2	P54868	508 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	ACTR3	P61158	418 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	TEX44	Q53QW1	395 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	RNF149	Q8NC42	400 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	UBA3	Q8TBC4	463 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	TWNK	Q96RR1	684 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	APOL6	Q9BWW8	343 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	PRPSAP2	O60256	369 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	APOE	P02649	317 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	PRKCB	P05771	671 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	LYN	P07948	512 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	RAB27A	P51159	221 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	GRM1	Q13255	1194 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	TFDP2	Q14188	446 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	STXBP2	Q15833	593 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	TEPSIN	Q96N21	525 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	KLC2	Q9H0B6	622 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	ACAD9	Q9H845	621 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	USP29	Q9HBJ7	922 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	PPME1	Q9Y570	386 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ZNF3-215	ENST00000487620	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZNF3-215	ENST00000487620	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZNF3-215	ENST00000487620	MICAL2	O94851	1124 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZNF3-215	ENST00000487620	EGFR	P00533	1210 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZNF3-215	ENST00000487620	HMGCR	P04035	888 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZNF3-215	ENST00000487620	PDGFRA	P16234	1089 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZNF3-215	ENST00000487620	SLC25A3	Q00325	362 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZNF3-215	ENST00000487620	STX3	Q13277	289 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZNF3-215	ENST00000487620	GSTA3	Q16772	222 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZNF3-215	ENST00000487620	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZNF3-215	ENST00000487620	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
ZNF3-215	ENST00000487620	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZNF3-215	ENST00000487620	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZNF3-215	ENST00000487620	REPS2	Q8NFH8	660 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZNF3-215	ENST00000487620	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
ZNF3-215	ENST00000487620	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZNF3-215	ENST00000487620	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
ZNF3-215	ENST00000487620	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZNF3-215	ENST00000487620	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZNF3-215	ENST00000487620	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZNF3-215	ENST00000487620	PDP2	Q9P2J9	529 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZNF3-215	ENST00000487620	FZD1	Q9UP38	647 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZNF3-215	ENST00000487620	PCNT	O95613	3336 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZNF3-215	ENST00000487620	ANK1	P16157	1881 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZNF3-215	ENST00000487620	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
ZNF3-215	ENST00000487620	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
ZNF3-215	ENST00000487620	BPGM	P07738	259 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ZNF3-215	ENST00000487620	SERPINA6	P08185	405 aa		10.14	□□□□□ -0.79

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