RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM171BQ6P995 826 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 C4orf50Q6ZRC1 276 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 SYT13Q7L8C5 426 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 ENGASEQ8NFI3 743 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 MYLPFQ96A32 169 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 TASP1Q9H6P5 420 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 IL21Q9HBE4 155 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 CRTAC1Q9NQ79 661 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 GKN1Q9NS71 199 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 RMND1Q9NWS8 449 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 TOR4AQ9NXH8 423 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 OBP2AQ9NY56 170 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 ZMYM5Q9UJ78 669 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 PILRBQ9UKJ0 227 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 MYO9AB2RTY4 2548 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDSPL-208ENST00000486978 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 MYOFQ9NZM1 2061 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 A8MXQ7 604 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 IKBKBO14920 756 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 CBFA2T3O75081 653 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 ATG13O75143 517 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 NOL4O94818 638 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 CLSTN1O94985 981 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 SMC2O95347 1197 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 VNN1O95497 513 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 F11P03951 625 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 PDGFRBP09619 1106 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 KRT13P13646 458 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 ARSAP15289 507 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 BDNFP23560 247 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 PIK3CAP42336 1068 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 ABCG1P45844 678 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 VAMP7P51809 220 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 NLRP12P59046 1061 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 CYP27A1Q02318 531 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 ENPEPQ07075 957 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 LMAN2Q12907 356 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 ADAM9Q13443 819 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 DDR2Q16832 855 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 EDRF1Q3B7T1 1238 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 ZACNQ401N2 412 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 ZCWPW2Q504Y3 356 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 COBLL1Q53SF7 1204 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 ARSIQ5FYB1 569 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF667Q5HYK9 610 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 MDH1BQ5I0G3 518 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 COLEC12Q5KU26 742 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 C1orf228Q6PIY5 440 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 VSTM1Q6UX27 236 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 SV2AQ7L0J3 742 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 TMEM150AQ86TG1 271 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 RASSF3Q86WH2 238 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 SYT12Q8IV01 421 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 SFTPA1Q8IWL2 248 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 SCN4BQ8IWT1 228 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 PLPP6Q8IY26 295 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM186BQ8IYM0 893 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 CMTM8Q8IZV2 173 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 MINDY1Q8N5J2 469 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM181AQ8N9Y4 354 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 STKLD1Q8NE28 680 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 MDGA1Q8NFP4 955 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 OR6B3Q8NGW1 331 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 OLIG1Q8TAK6 271 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 TAF4BQ92750 862 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 PCED1BQ96HM7 432 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 SPATA17Q96L03 361 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 MYRFLQ96LU7 910 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 CEP295NLQ96MC4 621 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 TIGD1Q96MW7 591 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 GSDMAQ96QA5 445 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM83CQ9BQN1 747 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 EBF3Q9H4W6 596 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 SMYD3Q9H7B4 428 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 CAPN10Q9HC96 672 aa6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CTDSPL-208ENST00000486978 NME7Q9Y5B8 376 aa6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms