RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM170A	A1A519	330 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959		E7ENQ6	273 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZBED1	O96006	694 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	EGF	P01133	1207 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	ATP1A3	P13637	1013 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF18	P17022	549 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	GNA15	P30679	374 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	USP8	P40818	1118 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	OPRD1	P41143	372 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	NUBP1	P53384	320 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	MFAP3	P55082	362 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	DAOA	P59103	153 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	CNGA2	Q16280	664 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	TSSK4	Q6SA08	328 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	MIB1	Q86YT6	1006 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	CPA6	Q8N4T0	437 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	MSANTD3	Q96H12	275 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	NACA2	Q9H009	215 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	GAN	Q9H2C0	597 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	THAP12	O43422	761 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	STC2	O76061	302 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	NFATC1	O95644	943 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	TDGF1	P13385	188 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	CLCN1	P35523	988 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	GPD2	P43304	727 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	SATB1	Q01826	763 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	EFEMP1	Q12805	493 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	DHCR24	Q15392	516 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959		Q6ZNB5	142 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	11.67	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	PASD1	Q8IV76	773 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	EDEM1	Q92611	657 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM122A	Q96E09	287 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRRX2	Q99811	253 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	E2F8	A0AVK6	867 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	SYCE3	A1L190	88 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	KLKB1	P03952	638 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	HMBS	P08397	361 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC6A11	P48066	632 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	GALK1	P51570	392 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC8A3	P57103	927 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	KDSR	Q06136	332 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	STIL	Q15468	1287 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959		R4GN57	208 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	LGALS16	A8MUM7	142 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959		E5RJQ4	531 aa		11.65	□□□□□ -0.54

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