RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475335.5

SIKE1-208, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIKE1, Length 470 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-208ENST00000475335 ZBED1O96006 694 aa22.09■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 OPRD1P41143 372 aa22.09■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 ADIGQ0VDE8 80 aa22.09■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 KCNJ12Q14500 433 aa22.09■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 DHCR24Q15392 516 aa22.09■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 ZNF528Q3MIS6 628 aa22.09■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 TCP11X2Q5H9J9 407 aa22.09■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 BBS7Q8IWZ6 715 aa22.09■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 SHC3Q92529 594 aa22.09■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 C2orf42Q9NWW7 574 aa22.09■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.09■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 M0QYV0 167 aa22.08■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 IRF1P10914 325 aa22.08■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 GALK1P51570 392 aa22.08■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 STILQ15468 1287 aa22.08■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 PMF1Q6P1K2 205 aa22.08■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 PKN3Q6P5Z2 889 aa22.08■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 RHBDF2Q6PJF5 856 aa22.08■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 SCML4Q8N228 414 aa22.08■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 SYNPOQ8N3V7 929 aa22.08■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 SPEM1Q8N4L4 309 aa22.08■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 P2RY13Q9BPV8 354 aa22.08■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 NACA2Q9H009 215 aa22.08■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 ACP6Q9NPH0 428 aa22.08■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 TBC1D14Q9P2M4 693 aa22.08■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 DNMT3LQ9UJW3 386 aa22.08■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 ZNF292O60281 2723 aa22.07■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 EGFP01133 1207 aa22.07■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 KRT5P13647 590 aa22.07■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 RPL34P49207 117 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 MRE11P49959 708 aa22.07■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 MFAP3P55082 362 aa22.07■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 AMPD2Q01433 879 aa22.07■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 SATB1Q01826 763 aa22.07■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 MESP2Q0VG99 397 aa22.07■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 MEA1Q16626 185 aa22.07■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 C10orf120Q5SQS8 335 aa22.07■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 Q6ZNB5 142 aa22.07■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 HTR3DQ70Z44 454 aa22.07■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 OTUB2Q96DC9 234 aa22.07■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 GPD2P43304 727 aa22.06■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 RGS7P49802 495 aa22.06■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 KCNMA1Q12791 1236 aa22.06■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 NR1H3Q13133 447 aa22.06■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 STX1AQ16623 288 aa22.06■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 SMYD5Q6GMV2 418 aa22.06■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 DENND1BQ6P3S1 775 aa22.06■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 TSSK4Q6SA08 328 aa22.06■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 C12orf40Q86WS4 652 aa22.06■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 ARHGAP18Q8N392 663 aa22.06■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 CD101Q93033 1021 aa22.06■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 FAM81BQ96LP2 452 aa22.06■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 LRRC4Q9HBW1 653 aa22.06■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 CNGB3Q9NQW8 809 aa22.06■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 ANO10Q9NW15 660 aa22.06■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa22.06■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 R4GN57 208 aa22.06■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 GPR179Q6PRD1 2367 aa22.06■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 YJEFN3A6XGL0 299 aa22.05■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 E7ENQ6 273 aa22.05■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 STC2O76061 302 aa22.05■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 RALAP11233 206 aa22.05■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 DRD1P21728 446 aa22.05■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 CCR3P51677 355 aa22.05■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 DAOAP59103 153 aa22.05■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 ARHGAP44Q17R89 818 aa22.05■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 LY6G5CQ5SRR4 150 aa22.05■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 TADA2BQ86TJ2 420 aa22.05■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 HSFY1Q96LI6 401 aa22.05■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 TAB2Q9NYJ8 693 aa22.05■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 FANCMQ8IYD8 2048 aa22.05■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 CFAP54Q96N23 3096 aa22.05■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa22.05■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 K7ESF4 209 aa22.04■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 ADH1CP00326 375 aa22.04■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 KLKB1P03952 638 aa22.04■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 ADH5P11766 374 aa22.04■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 KRT31Q15323 416 aa22.04■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.04■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 MIB1Q86YT6 1006 aa22.04■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa22.04■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa22.04■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 ZBTB44Q8NCP5 570 aa22.04■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 ZNF606Q8WXB4 792 aa22.04■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 P2RY11Q96G91 374 aa22.04■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 HSD3B7Q9H2F3 369 aa22.04■■□□□ 1.12
SIKE1-208ENST00000475335 CYTH4Q9UIA0 394 aa22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms