RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475304.5

TAPBP-238, Transcript of TAP binding protein, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TAPBP, Length 1,686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAPBP-238	ENST00000475304	KAZN	Q674X7	775 aa		18.05	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	18.05	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	MREG	Q8N565	214 aa		18.05	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	CCDC89	Q8N998	374 aa		18.05	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		18.05	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		18.05	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	PEBP4	Q96S96	227 aa		18.05	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		18.05	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	COMMD8	Q9NX08	183 aa		18.05	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	STK39	Q9UEW8	545 aa		18.05	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	NFU1	Q9UMS0	254 aa		18.05	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		18.04	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	LIAS	O43766	372 aa		18.04	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	APOC2	P02655	101 aa		18.04	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	MYBL2	P10244	700 aa		18.04	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	KRT10	P13645	584 aa		18.04	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	18.04	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	GRIK1	P39086	918 aa		18.04	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	18.04	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	GATM	P50440	423 aa		18.04	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	18.04	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	CAV1	Q03135	178 aa		18.04	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	18.04	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		18.04	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	18.04	■□□□□ 0.48	3e-8	■■■□□ 17
TAPBP-238	ENST00000475304	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	18.04	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	LRRC45	Q96CN5	670 aa		18.04	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		18.04	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		18.04	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	18.04	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	CALN1	Q9BXU9	219 aa		18.04	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		18.04	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		18.04	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	CHST7	Q9NS84	486 aa		18.04	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	CST8	O60676	142 aa		18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	ITGAV	P06756	1048 aa		18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	TGM2	P21980	687 aa		18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	NDUFV1	P49821	464 aa		18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	DPYSL3	Q14195	570 aa		18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	ZNF365	Q70YC5	407 aa		18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	RFX6	Q8HWS3	928 aa		18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	NTAN1	Q96AB6	310 aa		18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	CCDC114	Q96M63	670 aa		18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	TMEM209	Q96SK2	561 aa		18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	WHRN	Q9P202	907 aa		18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	ESYT3	A0FGR9	886 aa		18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	DAPK3	O43293	454 aa		18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	USP17L7	P0C7H9	530 aa		18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	ITIH2	P19823	946 aa		18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	CACNA2D1	P54289	1103 aa		18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	KRT17	Q04695	432 aa		18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	DEUP1	Q05D60	604 aa		18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	CALCOCO2	Q13137	446 aa		18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	GPR17	Q13304	367 aa		18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	USP41	Q3LFD5	358 aa		18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	18.03	■□□□□ 0.48	3e-9	■■□□□ 12.5
TAPBP-238	ENST00000475304	CEP57	Q86XR8	500 aa		18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	FAF2	Q96CS3	445 aa		18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	RNF157	Q96PX1	679 aa		18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	OGFR	Q9NZT2	677 aa		18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		18.03	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		18.02	■□□□□ 0.48
TAPBP-238	ENST00000475304	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		18.02	■□□□□ 0.47
TAPBP-238	ENST00000475304		E7ENQ6	273 aa		18.02	■□□□□ 0.47
TAPBP-238	ENST00000475304		M0QYT0	321 aa		18.02	■□□□□ 0.47
TAPBP-238	ENST00000475304	TBC1D4	O60343	1298 aa		18.02	■□□□□ 0.47
TAPBP-238	ENST00000475304	EFEMP2	O95967	443 aa		18.02	■□□□□ 0.47
TAPBP-238	ENST00000475304	LAG3	P18627	525 aa		18.02	■□□□□ 0.47
TAPBP-238	ENST00000475304	SNX1	Q13596	522 aa		18.02	■□□□□ 0.47
TAPBP-238	ENST00000475304	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		18.02	■□□□□ 0.47
TAPBP-238	ENST00000475304	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		18.02	■□□□□ 0.47
TAPBP-238	ENST00000475304	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		18.02	■□□□□ 0.47
TAPBP-238	ENST00000475304	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		18.02	■□□□□ 0.47
TAPBP-238	ENST00000475304	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		18.02	■□□□□ 0.47
TAPBP-238	ENST00000475304	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	18.02	■□□□□ 0.47
TAPBP-238	ENST00000475304	CWH43	Q9H720	699 aa		18.02	■□□□□ 0.47
TAPBP-238	ENST00000475304	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		18.02	■□□□□ 0.47
TAPBP-238	ENST00000475304	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	18.02	■□□□□ 0.47
TAPBP-238	ENST00000475304	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	18.02	■□□□□ 0.47
TAPBP-238	ENST00000475304	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	18.02	■□□□□ 0.47
TAPBP-238	ENST00000475304	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		18.02	■□□□□ 0.47
TAPBP-238	ENST00000475304	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	18.01	■□□□□ 0.47
TAPBP-238	ENST00000475304	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	18.01	■□□□□ 0.47
TAPBP-238	ENST00000475304	COL4A6	Q14031	1691 aa		18.01	■□□□□ 0.47
TAPBP-238	ENST00000475304	TNFRSF10B	O14763	440 aa		18.01	■□□□□ 0.47
TAPBP-238	ENST00000475304	UPP2	O95045	317 aa		18.01	■□□□□ 0.47
TAPBP-238	ENST00000475304	NCAM1	P13591	858 aa		18.01	■□□□□ 0.47
TAPBP-238	ENST00000475304	ARL4A	P40617	200 aa		18.01	■□□□□ 0.47

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