RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462392.5

IMP4-210, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 3

Gene IMP4, Length 1,793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-210ENST00000462392 CAPN2P17655 700 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 ECHS1P30084 290 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 DYNLT1P63172 113 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 DEFB103AP81534 67 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 DPYSL3Q14195 570 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 KRT81Q14533 505 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 EMBQ6PCB8 327 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 TAS1R1Q7RTX1 841 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 HDXQ7Z353 690 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 TMEM199Q8N511 208 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 ATL2Q8NHH9 583 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 HAUS1Q96CS2 278 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 FAM114A2Q9NRY5 505 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 USP3Q9Y6I4 520 aa21.4■■□□□ 1.02
IMP4-210ENST00000462392 ACRP10323 421 aa21.39■■□□□ 1.01
IMP4-210ENST00000462392 MMRN1Q13201 1228 aa21.39■■□□□ 1.01
IMP4-210ENST00000462392 CASP8Q14790 479 aa21.39■■□□□ 1.01
IMP4-210ENST00000462392 PDK2Q15119 407 aa21.39■■□□□ 1.01
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IMP4-210ENST00000462392 ERMARDQ5T6L9 678 aa21.39■■□□□ 1.01
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IMP4-210ENST00000462392 BBS12Q6ZW61 710 aa21.39■■□□□ 1.01
IMP4-210ENST00000462392 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.01
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IMP4-210ENST00000462392 SCN4BQ8IWT1 228 aa21.39■■□□□ 1.01
IMP4-210ENST00000462392 SCAMP5Q8TAC9 235 aa21.39■■□□□ 1.01
IMP4-210ENST00000462392 IRGQQ8WZA9 623 aa21.39■■□□□ 1.01
IMP4-210ENST00000462392 CCDC114Q96M63 670 aa21.39■■□□□ 1.01
IMP4-210ENST00000462392 PGLYRP2Q96PD5 576 aa21.39■■□□□ 1.01
IMP4-210ENST00000462392 TTPALQ9BTX7 342 aa21.39■■□□□ 1.01
IMP4-210ENST00000462392 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
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IMP4-210ENST00000462392 M0QYT0 321 aa21.38■■□□□ 1.01
IMP4-210ENST00000462392 MAP2K7O14733 419 aa21.38■■□□□ 1.01
IMP4-210ENST00000462392 LIASO43766 372 aa21.38■■□□□ 1.01
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IMP4-210ENST00000462392 SLC5A3P53794 718 aa21.38■■□□□ 1.01
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IMP4-210ENST00000462392 PPP1R7Q15435 360 aa21.38■■□□□ 1.01
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IMP4-210ENST00000462392 FAM131BQ86XD5 332 aa21.38■■□□□ 1.01
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IMP4-210ENST00000462392 SCML4Q8N228 414 aa21.38■■□□□ 1.01
IMP4-210ENST00000462392 CCDC185Q8N715 623 aa21.38■■□□□ 1.01
IMP4-210ENST00000462392 GRK7Q8WTQ7 553 aa21.38■■□□□ 1.01
IMP4-210ENST00000462392 PCDH18Q9HCL0 1135 aa21.38■■□□□ 1.01
IMP4-210ENST00000462392 FAM153AQ9UHL3 310 aa21.38■■□□□ 1.01
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IMP4-210ENST00000462392 LTBP2Q14767 1821 aa21.38■■□□□ 1.01
IMP4-210ENST00000462392 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa21.38■■□□□ 1.01
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IMP4-210ENST00000462392 NCAM1P13591 858 aa21.38■■□□□ 1.01
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IMP4-210ENST00000462392 KRT17Q04695 432 aa21.38■■□□□ 1.01
IMP4-210ENST00000462392 VSTM1Q6UX27 236 aa21.38■■□□□ 1.01
IMP4-210ENST00000462392 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
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IMP4-210ENST00000462392 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
IMP4-210ENST00000462392 NEUROG2Q9H2A3 272 aa21.38■■□□□ 1.01
IMP4-210ENST00000462392 COX16Q9P0S2 106 aa21.38■■□□□ 1.01
IMP4-210ENST00000462392 DNPEPQ9ULA0 475 aa21.38■■□□□ 1.01
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IMP4-210ENST00000462392 H7C4K7 107 aa21.37■■□□□ 1.01
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IMP4-210ENST00000462392 CPB1P15086 417 aa21.37■■□□□ 1.01
IMP4-210ENST00000462392 IL4RP24394 825 aa21.37■■□□□ 1.01
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IMP4-210ENST00000462392 SLC7A14Q8TBB6 771 aa21.37■■□□□ 1.01
IMP4-210ENST00000462392 EDEM1Q92611 657 aa21.37■■□□□ 1.01
IMP4-210ENST00000462392 CAVIN3Q969G5 261 aa21.37■■□□□ 1.01
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IMP4-210ENST00000462392 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
IMP4-210ENST00000462392 BSPRYQ5W0U4 402 aa21.36■■□□□ 1.01
IMP4-210ENST00000462392 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
IMP4-210ENST00000462392 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
IMP4-210ENST00000462392 ADAM32Q8TC27 787 aa21.36■■□□□ 1.01
IMP4-210ENST00000462392 FAM71BQ8TC56 605 aa21.36■■□□□ 1.01
IMP4-210ENST00000462392 ACTL9Q8TC94 416 aa21.36■■□□□ 1.01
IMP4-210ENST00000462392 IGSF21Q96ID5 467 aa21.36■■□□□ 1.01
IMP4-210ENST00000462392 RNF157Q96PX1 679 aa21.36■■□□□ 1.01
IMP4-210ENST00000462392 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
IMP4-210ENST00000462392 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
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