RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 CENPTQ96BT3 561 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 SENP8Q96LD8 212 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 CFAP57Q96MR6 1250 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 RUFY1Q96T51 708 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 GAD1Q99259 594 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 NPY6RQ99463 290 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 SMOQ99835 787 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF670Q9BS34 389 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 DHRS4Q9BTZ2 278 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 APOL6Q9BWW8 343 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 CAPS2Q9BXY5 557 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC134Q9H6E4 229 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ZWILCHQ9H900 591 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 PLAC1Q9HBJ0 212 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 SLC38A7Q9NVC3 462 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 SRRDQ9UH36 339 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ASIC3Q9UHC3 531 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ANAPC5Q9UJX4 755 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 PADI3Q9ULW8 664 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 CLUHO75153 1309 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 TET1Q8NFU7 2136 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 MYO16Q9Y6X6 1858 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 TTC3P53804 2025 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 C5orf60A6NFR6 353 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 CYB561D2O14569 222 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 NRP1O14786 923 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 GPR182O15218 404 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 HUS1O60921 280 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 AOC2O75106 756 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 CABYRO75952 493 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 RNF8O76064 485 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM63AO94886 807 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 AGTP01019 485 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 AMHP03971 560 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 PDGFRBP09619 1106 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 NPR3P17342 541 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 CAPN2P17655 700 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 TGM2P21980 687 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 CD52P31358 61 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 LSP1P33241 339 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 ADCY8P40145 1251 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 MLH1P40692 756 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 MATKP42679 507 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 MAGEA3P43357 314 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 SCNN1GP51170 649 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 CLCNKBP51801 687 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 ACLYP53396 1101 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 SNX16P57768 344 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 DAOAP59103 153 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 PPP2R2AP63151 447 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 SP3Q02447 781 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 GAD2Q05329 585 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 DSC1Q08554 894 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 SCAPQ12770 1279 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 KCNJ11Q14654 390 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 GPNMBQ14956 572 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 PTGISQ16647 500 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 ZSCAN26Q16670 478 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 KYNUQ16719 465 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 SLC25A52Q3SY17 297 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 MSS51Q4VC12 460 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 TIGD5Q53EQ6 642 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 FAM47CQ5HY64 1035 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD22Q5VYY1 191 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 KAZNQ674X7 775 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 VSTM1Q6UX27 236 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 NPNTQ6UXI9 565 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 BEND5Q7L4P6 421 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 CROCCP2Q86T23 111 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 RSPH3Q86UC2 560 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 FAM35AQ86V20 835 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 PIGZQ86VD9 579 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 HOOK3Q86VS8 718 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 TDRPQ86YL5 185 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 CRIPAKQ8N1N5 446 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 RNF169Q8NCN4 708 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 PXYLP1Q8TE99 480 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 FAM172AQ8WUF8 416 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 MAML1Q92585 1016 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 DPF3Q92784 378 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 LPPQ93052 612 aa5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms