RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 SGO2Q562F6 1265 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 TCP11X2Q5H9J9 407 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 HECTD3Q5T447 861 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC183Q5T5S1 534 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 CDKAL1Q5VV42 579 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 SMYD5Q6GMV2 418 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 PM20D1Q6GTS8 502 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 FSTL4Q6MZW2 842 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 DENND1BQ6P3S1 775 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 RHBDF2Q6PJF5 856 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 TSSK4Q6SA08 328 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 LCLAT1Q6UWP7 414 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 GBP6Q6ZN66 633 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 Q6ZS52 159 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 WDTC1Q8N5D0 677 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC35F5Q8WV83 523 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 SHDQ96IW2 340 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 FUCA2Q9BTY2 467 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 OSBPL6Q9BZF3 934 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 UBXN6Q9BZV1 441 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNH6Q9H252 994 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 VPS16Q9H269 839 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 NDST4Q9H3R1 872 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 KIF9Q9HAQ2 790 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 PNPLA8Q9NP80 782 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 FANCLQ9NW38 375 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 CFAP97Q9P2B7 532 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 ZMYM5Q9UJ78 669 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 THADAQ6YHU6 1953 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM170AA1A519 330 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 YJEFN3A6XGL0 299 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 E7ENQ6 273 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 ARHGAP33O14559 1287 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM24O15164 1050 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 EPHB6O15197 1021 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 KLKB1P03952 638 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 CYP17A1P05093 508 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 FYNP06241 537 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 PAEPP09466 180 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 SP9P0CG40 484 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 LCP1P13796 627 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 PFKLP17858 780 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 CLCN1P35523 988 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 GPD2P43304 727 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 PLA2G4AP47712 749 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 TKTL1P51854 596 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 SATB1Q01826 763 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 TYRO3Q06418 890 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 ADIGQ0VDE8 80 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 BST2Q10589 180 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 MTAPQ13126 283 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 CCINQ13939 588 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 KRT31Q15323 416 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 DHCR24Q15392 516 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM196Q5HYL7 178 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC186Q7Z3E2 898 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM25Q86YD3 366 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 C1orf210Q8IVY1 113 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 BBS7Q8IWZ6 715 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 TTC39CQ8N584 583 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 PDZD8Q8NEN9 1154 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF606Q8WXB4 792 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 CHRDQ9H2X0 955 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXO44Q9H4M3 255 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 CYLDQ9NQC7 956 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 APEX2Q9UBZ4 518 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 NAGPAQ9UK23 515 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 DNAJC12Q9UKB3 198 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 HCN2Q9UL51 889 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 FHOD1Q9Y613 1164 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 R4GN57 208 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 CFAP54Q96N23 3096 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 NUP205Q92621 2012 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 M0QYV0 167 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 MAN2B1O00754 1011 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 STC2O76061 302 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 ZBED1O96006 694 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 HMBSP08397 361 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP1A3P13637 1013 aa7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms