RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DNMT3LQ9UJW3 386 aa16.37■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KIAA1257Q9ULG3 409 aa16.37■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ATG13O75143 517 aa16.36■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RALAP11233 206 aa16.36■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GOLGA8FQ08AF8 430 aa16.36■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa16.36■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DPCR1Q3MIW9 517 aa16.36■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PKDCCQ504Y2 493 aa16.36■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LCLAT1Q6UWP7 414 aa16.36■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HTR3DQ70Z44 454 aa16.36■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TADA2BQ86TJ2 420 aa16.36■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C12orf40Q86WS4 652 aa16.36■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF276Q8N554 614 aa16.36■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa16.36■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KREMEN1Q96MU8 473 aa16.36■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZSWIM1Q9BR11 485 aa16.36■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ULBP1Q9BZM6 244 aa16.36■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM186AA6NE01 2351 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ATG2BQ96BY7 2078 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZBED1O96006 694 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CALCAP01258 141 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SETSIPP0DME0 302 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BRD2P25440 801 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PLA2G4AP47712 749 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC6A11P48066 632 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF132P52740 706 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP16.35■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GAD2Q05329 585 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ADIGQ0VDE8 80 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MESP2Q0VG99 397 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PM20D1Q6GTS8 502 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LONP2Q86WA8 852 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MIB1Q86YT6 1006 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ARHGAP18Q8N392 663 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CRACR2AQ9BSW2 395 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LRRC4Q9HBW1 653 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SPHK2Q9NRA0 654 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RASAL2Q9UJF2 1139 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP16.35■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC8A2Q9UPR5 921 aa16.35■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MYOFQ9NZM1 2061 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF292O60281 2723 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ANTXRLA6NF34 631 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 K7EQS6 105 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 M0QYV0 167 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HOXA6P31267 233 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SEC13P55735 322 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KDSRQ06136 332 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EFEMP1Q12805 493 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CNGA2Q16280 664 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BHLHA9Q7RTU4 235 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEM25Q86YD3 366 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SFTPA1Q8IWL2 248 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KCTD13Q8WZ19 329 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RUBCNQ92622 972 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PNKPQ96T60 521 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HINFPQ9BQA5 517 aa16.34■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa16.33■□□□□ 0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HRO43593 1189 aa16.33■□□□□ 0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 STC2O76061 302 aa16.33■□□□□ 0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KAT7O95251 611 aa16.33■□□□□ 0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KRT5P13647 590 aa16.33■□□□□ 0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PXNP49023 591 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 STILQ15468 1287 aa16.33■□□□□ 0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ANO4Q32M45 955 aa16.33■□□□□ 0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C2orf27AQ580R0 203 aa16.33■□□□□ 0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BTBD8Q5XKL5 378 aa16.33■□□□□ 0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GJB7Q6PEY0 223 aa16.33■□□□□ 0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRIM65Q6PJ69 517 aa16.33■□□□□ 0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GBP6Q6ZN66 633 aa16.33■□□□□ 0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 Q6ZNB5 142 aa16.33■□□□□ 0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SYT13Q7L8C5 426 aa16.33■□□□□ 0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 WDR5BQ86VZ2 330 aa16.33■□□□□ 0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa16.33■□□□□ 0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa16.33■□□□□ 0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NAT16Q8N8M0 369 aa16.33■□□□□ 0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCDC26Q8TAB7 109 aa16.33■□□□□ 0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 USP33Q8TEY7 942 aa16.33■□□□□ 0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC35F5Q8WV83 523 aa16.33■□□□□ 0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ACDQ96AP0 544 aa16.33■□□□□ 0.2
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms