RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 PM20D1Q6GTS8 502 aa21.85■■□□□ 1.09
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SH3BP2-204ENST00000452765 OSER1Q9NX31 292 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-204ENST00000452765 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.09
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SH3BP2-204ENST00000452765 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
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SH3BP2-204ENST00000452765 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
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SH3BP2-204ENST00000452765 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
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SH3BP2-204ENST00000452765 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2-204ENST00000452765 TRIM66O15016 1216 aa21.82■■□□□ 1.08
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SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF461Q8TAF7 563 aa21.82■■□□□ 1.08
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SH3BP2-204ENST00000452765 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
SH3BP2-204ENST00000452765 LRRC38Q5VT99 294 aa21.81■■□□□ 1.08
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SH3BP2-204ENST00000452765 ATG4AQ8WYN0 398 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BP2-204ENST00000452765 NT5C3BQ969T7 300 aa21.81■■□□□ 1.08
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