RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 ENGASEQ8NFI3 743 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 CHFRQ96EP1 664 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 SLITRK1Q96PX8 696 aa6.37□□□□□ -1.39
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PTPRR-204ENST00000440835 PLIN2Q99541 437 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 SYT15Q9BQS2 421 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 PDE11AQ9HCR9 933 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 ARFGAP3Q9NP61 516 aa6.37□□□□□ -1.39
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PTPRR-204ENST00000440835 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
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PTPRR-204ENST00000440835 KRT37O76014 449 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
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PTPRR-204ENST00000440835 P4HA1P13674 534 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRR-204ENST00000440835 LIG3P49916 1009 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 GOLGA8FQ08AF8 430 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 DDR2Q16832 855 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 DUOXA1Q1HG43 343 aa6.35□□□□□ -1.39
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