RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 LCP1P13796 627 aa11.29□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 OPRD1P41143 372 aa11.29□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 GPD2P43304 727 aa11.29□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 RPS9P46781 194 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 MESP2Q0VG99 397 aa11.29□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 DHCR24Q15392 516 aa11.29□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM196Q5HYL7 178 aa11.29□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 RHBDF2Q6PJF5 856 aa11.29□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 TSSK4Q6SA08 328 aa11.29□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 C12orf40Q86WS4 652 aa11.29□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 SFTPA1Q8IWL2 248 aa11.29□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 BBS7Q8IWZ6 715 aa11.29□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF606Q8WXB4 792 aa11.29□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 KCTD13Q8WZ19 329 aa11.29□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 SHC3Q92529 594 aa11.29□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 ATP2A3Q93084 1043 aa11.29□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 MSANTD3Q96H12 275 aa11.29□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 VPS16Q9H269 839 aa11.29□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 CHRDQ9H2X0 955 aa11.29□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 HESX1Q9UBX0 185 aa11.29□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 DNAJC12Q9UKB3 198 aa11.29□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 FHOD1Q9Y613 1164 aa11.29□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 E2F8A0AVK6 867 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 KLKB1P03952 638 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 SP9P0CG40 484 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 TDGF1P13385 188 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF18P17022 549 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 CLCN1P35523 988 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 USP8P40818 1118 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 SLC6A11P48066 632 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 RPL34P49207 117 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 MFAP3P55082 362 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 DAOAP59103 153 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP11.28□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 EFEMP1Q12805 493 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 C10orf120Q5SQS8 335 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 KLHDC10Q6PID8 442 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 CPA6Q8N4T0 437 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF276Q8N554 614 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 WDTC1Q8N5D0 677 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 FUCA2Q9BTY2 467 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 NACA2Q9H009 215 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 LRRC4Q9HBW1 653 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 CLIC5Q9NZA1 410 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 TJP2Q9UDY2 1190 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 MYOFQ9NZM1 2061 aa11.28□□□□□ -0.6
ATG4B-210ENST00000428861 PES1O00541 588 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 EPHB6O15197 1021 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 NCAM2O15394 837 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 STC2O76061 302 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 NFATC1O95644 943 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 ATP1A3P13637 1013 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 GNA15P30679 374 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 PSEN1P49768 467 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 COPB1P53618 953 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 SLC8A3P57103 927 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 SATB1Q01826 763 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 MYL5Q02045 173 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 STILQ15468 1287 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 ANO6Q4KMQ2 910 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 LY6G5CQ5SRR4 150 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 BSPRYQ5W0U4 402 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 C1orf228Q6PIY5 440 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 Q6ZNB5 142 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 HTR3DQ70Z44 454 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 SLC47A2Q86VL8 602 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP11.27□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM25Q86YD3 366 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 MIB1Q86YT6 1006 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 AOPEPQ8N6M6 819 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 KIAA1958Q8N8K9 716 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 EDEM1Q92611 657 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 P2RY13Q9BPV8 354 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 GANQ9H2C0 597 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 RASAL2Q9UJF2 1139 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 DNMT3LQ9UJW3 386 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 R4GN57 208 aa11.27□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 TRIM24O15164 1050 aa11.26□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 THAP12O43422 761 aa11.26□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 FYNP06241 537 aa11.26□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 HMBSP08397 361 aa11.26□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 RALAP11233 206 aa11.26□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 NBL1P41271 181 aa11.26□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 MAGEA9P43362 315 aa11.26□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms