RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 TPSD1Q9BZJ3 242 aa22.15■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 MYOFQ9NZM1 2061 aa22.15■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 SGK1O00141 431 aa22.14■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 TULP3O75386 442 aa22.14■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 TIE1P35590 1138 aa22.14■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 PSEN1P49768 467 aa22.14■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 KDSRQ06136 332 aa22.14■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 NUDT18Q6ZVK8 323 aa22.14■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 TERB1Q8NA31 727 aa22.14■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 RXFP3Q9NSD7 469 aa22.14■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 OSER1Q9NX31 292 aa22.14■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 MARK1Q9P0L2 795 aa22.14■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 DEC1Q9P2X7 70 aa22.14■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 CYP26A1O43174 497 aa22.13■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.138e-7■□□□□ 10.5
LIMS1-208ENST00000428064 ACO1P21399 889 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 GBP1P32455 592 aa22.13■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 KIF11P52732 1056 aa22.13■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.13■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 STPG1Q5TH74 334 aa22.13■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.13■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM25Q86YD3 366 aa22.13■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 WBP2Q969T9 261 aa22.13■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 STARD13Q9Y3M8 1113 aa22.13■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 CACNG3O60359 315 aa22.12■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 STX10O60499 249 aa22.12■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 ADAM23O75077 832 aa22.12■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 CAVIN2O95810 425 aa22.12■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 IRF1P10914 325 aa22.12■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 P2RY2P41231 377 aa22.12■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 MXI1P50539 228 aa22.12■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 CREB5Q02930 508 aa22.12■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 TADA2BQ86TJ2 420 aa22.12■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 FBXL13Q8NEE6 735 aa22.12■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 DUSP16Q9BY84 665 aa22.12■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.131e-7■■■■■ 154.6
LIMS1-208ENST00000428064 RMND1Q9NWS8 449 aa22.12■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 USP3Q9Y6I4 520 aa22.12■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 NUP205Q92621 2012 aa22.12■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 TBC1D3BA6NDS4 549 aa22.11■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 TBX18O95935 607 aa22.11■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 CD58P19256 250 aa22.11■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 ANO4Q32M45 955 aa22.11■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 SPDYCQ5MJ68 293 aa22.11■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 EMC10Q5UCC4 262 aa22.11■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 NAT16Q8N8M0 369 aa22.11■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 SPACA7Q96KW9 195 aa22.11■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 SMOC1Q9H4F8 434 aa22.11■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 MMRN2Q9H8L6 949 aa22.11■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 NMUR1Q9HB89 426 aa22.11■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 RAB20Q9NX57 234 aa22.11■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 CLIC5Q9NZA1 410 aa22.11■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 DNMT3LQ9UJW3 386 aa22.11■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PQH9 124 aa22.1■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 CETN3O15182 167 aa22.1■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 EPB41P11171 864 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 RARGP13631 454 aa22.1■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 BCKDHBP21953 392 aa22.1■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 PLA2G4AP47712 749 aa22.1■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 Q6ZNB5 142 aa22.1■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 SEMA4DQ92854 862 aa22.1■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 EDEM2Q9BV94 578 aa22.1■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 UBXN6Q9BZV1 441 aa22.1■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 WDR35Q9P2L0 1181 aa22.1■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.1■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 THADAQ6YHU6 1953 aa22.09■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 C10orf76Q5T2E6 689 aa22.09■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 RNF43Q68DV7 783 aa22.09■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 GRAMD4Q6IC98 578 aa22.09■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 TCEAL6Q6IPX3 200 aa22.09■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 TCEAL3Q969E4 200 aa22.09■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 JAKMIP2Q96AA8 810 aa22.09■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 GSDMAQ96QA5 445 aa22.09■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 BBS2Q9BXC9 721 aa22.09■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.09■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 CISHQ9NSE2 258 aa22.09■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 INVSQ9Y283 1065 aa22.09■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 SDK1Q7Z5N4 2213 aa22.08■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa22.08■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 LNP1A1A4G5 178 aa22.08■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 TYRP14679 529 aa22.08■■□□□ 1.13
LIMS1-208ENST00000428064 PNOCQ13519 176 aa22.08■■□□□ 1.13
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