RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LCP1P13796 627 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RPS9P46781 194 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KLK7P49862 253 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COPB1P53618 953 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PTPN5P54829 565 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP26.24■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C10orf120Q5SQS8 335 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C1orf228Q6PIY5 440 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BPIFA3Q9BQP9 254 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LMAN1LQ9HAT1 526 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DNMT3LQ9UJW3 386 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 H0Y858 1186 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NCAM2O15394 837 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 THAP12O43422 761 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RALAP11233 206 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RPL34P49207 117 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GAB4Q2WGN9 574 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARHGAP18Q8N392 663 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CYTH4Q9UIA0 394 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LRRC10BA6NIK2 292 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 YJEFN3A6XGL0 299 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 E7ENQ6 273 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CYP17A1P05093 508 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CLCN1P35523 988 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DAOAP59103 153 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANGPT1Q15389 498 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MEA1Q16626 185 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SMYD5Q6GMV2 418 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C1orf210Q8IVY1 113 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM71AQ8IYT1 594 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SCML4Q8N228 414 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HSFY1Q96LI6 401 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CNGB3Q9NQW8 809 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MIA3Q5JRA6 1907 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CACNA1HO95180 2353 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SYCE3A1L190 88 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MED7O43513 233 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NFATC1O95644 943 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ATP1A3P13637 1013 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UCHL3P15374 230 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MAGEA9P43362 315 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NHLH1Q02575 133 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCINQ13939 588 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM196Q5HYL7 178 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BBS7Q8IWZ6 715 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CLEC4CQ8WTT0 213 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GANQ9H2C0 597 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLCB1Q9NQ66 1216 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GALK1P51570 392 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EFEMP1Q12805 493 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RAPGEF1Q13905 1077 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GAS6Q14393 721 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DHCR24Q15392 516 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BSPRYQ5W0U4 402 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FSTL4Q6MZW2 842 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RHBDF2Q6PJF5 856 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HTR3DQ70Z44 454 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TADA2BQ86TJ2 420 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC47A2Q86VL8 602 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MIB1Q86YT6 1006 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WDTC1Q8N5D0 677 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CHRDQ9H2X0 955 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TBC1D14Q9P2M4 693 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SIK3Q9Y2K2 1263 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DMDP11532 3685 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LGALS16A8MUM7 142 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EPHB6O15197 1021 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PTK2Q05397 1052 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MTAPQ13126 283 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FKBP15Q5T1M5 1219 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC4A5Q9BY07 1137 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RASAL2Q9UJF2 1139 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MYO15AQ9UKN7 3530 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 STC2O76061 302 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TPM2P07951 284 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PTMSP20962 102 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF165P49910 485 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AMPD2Q01433 879 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NR1H3Q13133 447 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BTBD8Q5XKL5 378 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 Q6ZS52 159 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 STK32AQ8WU08 396 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IRGQQ8WZA9 623 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EDEM1Q92611 657 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OTUB2Q96DC9 234 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXD-AS2-201ENST00000426965 P2RY13Q9BPV8 354 aa26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms