RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409251.7

PTPRN-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-202ENST00000409251 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 DEFB107AQ8IZN7 70 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 PPP2R3CQ969Q6 453 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 FGFR3P22607 806 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 MAN1A1P33908 653 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 GK3PQ14409 553 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 C16orf72Q14CZ0 275 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 CRLF3Q8IUI8 442 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 TTC25Q96NG3 672 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 PCYT2Q99447 389 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 RNPEPQ9H4A4 650 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 AKT3Q9Y243 479 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 FDX1P10109 184 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 GMPRP36959 345 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 NRF1Q16656 503 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 BMT2Q1RMZ1 405 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 FNBP1LQ5T0N5 605 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 RHBDF2Q6PJF5 856 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 HACE1Q8IYU2 909 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 ATP11CQ8NB49 1132 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 PGBD4Q96DM1 585 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 DTNBP1Q96EV8 351 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 NMRK2Q9NPI5 230 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 SAR1AQ9NR31 198 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 GOLGA8OA6NCC3 632 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 GOLGA8NF8WBI6 632 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 VCLP18206 1134 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 KCNA4P22459 653 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 ANXA13P27216 316 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 ADORA2AP29274 412 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 CDO1Q16878 200 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 WDR44Q5JSH3 913 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 NXNQ6DKJ4 435 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 IL31Q6EBC2 164 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 ACAD10Q6JQN1 1059 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 TAS1R3Q7RTX0 852 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 SERAC1Q96JX3 654 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 FAM192AQ9GZU8 254 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 UVRAGQ9P2Y5 699 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 XPOTO43592 962 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 OSBPP22059 807 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 PDE1BQ01064 536 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 SLC44A4Q53GD3 710 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 ARPINQ7Z6K5 226 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 RFX6Q8HWS3 928 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 TMPRSS6Q8IU80 811 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 CHST13Q8NET6 341 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 AFG1LQ8WV93 481 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 SEPT1Q8WYJ6 367 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 CDHR1Q96JP9 859 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 C12orf42Q96LP6 360 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 HEY1Q9Y5J3 304 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 BTBD19C9JJ37 291 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 H7C0C1 242 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 TMCC1O94876 653 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 GCAP28676 217 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 ELK3P41970 407 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 ATP5OP48047 213 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 C1orf220Q5T0J3 134 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 RIOX2Q8IUF8 465 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 OR5B17Q8NGF7 314 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 CAAP1Q9H8G2 361 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 PLA2G4CQ9UP65 541 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 EXOC7Q9UPT5 735 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 PTPRJQ12913 1337 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 GLTPD2A6NH11 291 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 E9PBE3 544 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 KLHL41O60662 606 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 CST8O60676 142 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 WEE2P0C1S8 567 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 GRIA2P42262 883 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 GDF10P55107 478 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 GTF2BQ00403 316 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 NDUFAF2Q8N183 169 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 E2F7Q96AV8 911 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 CPB2Q96IY4 423 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-202ENST00000409251 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms