RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391046.1

RNU6-1300P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1300, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1300P, Length 108 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1300P-201ENST00000391046 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 RAB11FIP2Q7L804 512 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 MRGPREQ86SM8 312 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 IL17REQ8NFR9 667 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 OR6Y1Q8NGX8 325 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 THAP4Q8WY91 577 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 RFKQ969G6 155 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 SDCCAG3Q96C92 435 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 CTHRC1Q96CG8 243 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 ZNF503Q96F45 646 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 FBXL20Q96IG2 436 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 AIFM2Q9BRQ8 373 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 TTPALQ9BTX7 342 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 WDR11Q9BZH6 1224 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 EHD3Q9NZN3 535 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 ZNF69Q9UC07 566 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 SH2B3Q9UQQ2 575 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 A8MVJ9 347 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 EFCAB8A8MWE9 144 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 H0Y3Z8 333 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 MPPED1O15442 326 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 PEX1O43933 1283 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 PPP6R2O75170 966 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 PMPCBO75439 489 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 RPP40O75818 363 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 AGR2O95994 175 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 PRKCBP05771 671 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 CHRM2P08172 466 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 TMEM225BP0DP42 221 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 CKMT1AP12532 417 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 CD53P19397 219 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 GKP32189 559 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 CDK7P50613 346 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 CLCN2P51788 898 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 PRKAA2P54646 552 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 FOXE3Q13461 319 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 TUBA3CQ13748 450 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 BMPR2Q13873 1038 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 FAM110CQ1W6H9 321 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 TMEM196Q5HYL7 178 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 ANKRD45Q5TZF3 282 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 FAM90A2PQ658T7 463 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 TUBA3EQ6PEY2 450 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 KCNV1Q6PIU1 500 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 RRAGAQ7L523 313 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 TRABD2AQ86V40 505 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 PROKR1Q8TCW9 393 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 AFG1LQ8WV93 481 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 XAGE5Q8WWM1 108 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 WDYHV1Q96HA8 205 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 PAAF1Q9BRP4 392 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 MLST8Q9BVC4 326 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 TWSG1Q9GZX9 223 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 BRD8Q9H0E9 1235 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 RXFP3Q9NSD7 469 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 PDP2Q9P2J9 529 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 FEM1BQ9UK73 627 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 NFU1Q9UMS0 254 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 GABRQQ9UN88 632 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 CNTN6Q9UQ52 1028 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 A0A1B0GVC2 190 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 RRN3P2A6NIE6 340 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 CTIFO43310 598 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 SPRY2O43597 315 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 NXPH3O95157 252 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 GSTM5P46439 218 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 DGKQP52824 942 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 BLOC1S1P78537 153 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 KCNJ12Q14500 433 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 RALBP1Q15311 655 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 CYP1B1Q16678 543 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 ST3GAL2Q16842 350 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 TXNRD1Q16881 649 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 P3H1Q32P28 736 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 SPATS1Q496A3 300 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 LY6G5CQ5SRR4 150 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 TTC22Q5TAA0 569 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 FNDC7Q5VTL7 733 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 OVCA2Q8WZ82 227 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 C3orf49Q96BT1 292 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 MCRS1Q96EZ8 462 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 RIC8AQ9NPQ8 531 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1300P-201ENST00000391046 MAST3O60307 1309 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1300P-201ENST00000391046 GXYLT2A0PJZ3 443 aa4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms