RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389048.7

ALK-201, Transcript of ALK receptor tyrosine kinase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALK, Length 6,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALK-201ENST00000389048 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 PRR36Q9H6K5 1346 aa15.98■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 ERVK-10P10266 1014 aa15.98■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 SRP54P61011 504 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 POU6F1Q14863 301 aa15.98■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 TMEM26Q6ZUK4 368 aa15.98■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 VPS33BQ9H267 617 aa15.98■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa15.98■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 TNNI3P19429 210 aa15.98■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 PDLIM2Q96JY6 352 aa15.98■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 ZSWIM1Q9BR11 485 aa15.98■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 KIFC1Q9BW19 673 aa15.98■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 TAGLN3Q9UI15 199 aa15.98■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 F5H5T6 163 aa15.98■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 CBX4O00257 560 aa15.98■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 ATG7O95352 703 aa15.98■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 FGD3Q5JSP0 725 aa15.98■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 GLB1LQ6UWU2 654 aa15.98■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 C3orf67Q6ZVT6 689 aa15.98■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 FAM131BQ86XD5 332 aa15.98■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 ARMCX1Q9P291 453 aa15.98■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 DYRK1BQ9Y463 629 aa15.98■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 NUDT14O95848 222 aa15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 CD44P16070 742 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 STILQ15468 1287 aa15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 CYP4Z1Q86W10 505 aa15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 SLC20A1Q8WUM9 679 aa15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 DGCR6LQ9BY27 220 aa15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 GPAMQ9HCL2 828 aa15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 KCNH7Q9NS40 1196 aa15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 TBX20Q9UMR3 447 aa15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 LINC00523Q86TU6 105 aa15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 CBWD2Q8IUF1 395 aa15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 TMBIM4Q9HC24 238 aa15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 ACAP1Q15027 740 aa15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 KDM7AQ6ZMT4 941 aa15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 TMC2Q8TDI7 906 aa15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 MXRA8Q9BRK3 442 aa15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 TMEM106CQ9BVX2 250 aa15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 ANXA9O76027 345 aa15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 CACNA2D1P54289 1103 aa15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 GEMP55040 296 aa15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 GRIK3Q13003 919 aa15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 SERAC1Q96JX3 654 aa15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 TBCDQ9BTW9 1192 aa15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 VCPKMTQ9H867 229 aa15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 MIEF1Q9NQG6 463 aa15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 LBPP18428 481 aa15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 NR6A1Q15406 480 aa15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 DDR2Q16832 855 aa15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 CLEC4GQ6UXB4 293 aa15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 ATG9AQ7Z3C6 839 aa15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 SGMS1Q86VZ5 419 aa15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa15.97■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 TALDO1P37837 337 aa15.96■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 LLGL2Q6P1M3 1020 aa15.96■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 ZBTB46Q86UZ6 589 aa15.96■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 FBXO32Q969P5 355 aa15.96■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa15.96■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 WDR27A2RRH5 827 aa15.96■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 CASTOR2A6NHX0 329 aa15.96■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 INPP4BO15327 924 aa15.96■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 SPAG6O75602 509 aa15.96■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 RAG1P15918 1043 aa15.96■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 SLC1A6P48664 564 aa15.96■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 DDI1Q8WTU0 396 aa15.96■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 SLITRK1Q96PX8 696 aa15.96■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 TP73O15350 636 aa15.96■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 ASNA1O43681 348 aa15.96■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 MAPK7Q13164 816 aa15.96■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 TOMM20Q15388 145 aa15.96■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa15.96■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 KIF2CQ99661 725 aa15.96■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 STK39Q9UEW8 545 aa15.96■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 A0A087X0T9 212 aa15.96■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 H3BN98 237 aa15.96■□□□□ 0.15
ALK-201ENST00000389048 FAM228BP0C875 321 aa15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms