RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384540.1

RNU6-601P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 601, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-601P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-601P-201ENST00000384540 CNGA2Q16280 664 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 ST3GAL2Q16842 350 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 LEXMQ3ZCV2 418 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM102BQ5T8I3 360 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 USP49Q70CQ1 688 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 WASF1Q92558 559 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZFYVE19Q96K21 471 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 STK31Q9BXU1 1019 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 COL20A1Q9P218 1284 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 HEY2Q9UBP5 337 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 DKK4Q9UBT3 224 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 STEAP1Q9UHE8 339 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 VPS51Q9UID3 782 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 MID2Q9UJV3 735 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF580Q9UK33 172 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 TPCN1Q9ULQ1 816 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 A6NNZ2 444 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 CLIC1O00299 241 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 INMTO95050 263 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 SCP2P22307 547 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 TKTP29401 623 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 ITGA8P53708 1063 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 DEUP1Q05D60 604 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC14A1Q13336 389 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC29A2Q14542 456 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 MFSD13AQ14CX5 517 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 MINDY4Q4G0A6 757 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 KLHL22Q53GT1 634 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 C3orf38Q5JPI3 329 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 NXNQ6DKJ4 435 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 YAF2Q8IY57 180 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 METTL25Q8N6Q8 603 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 MPLKIPQ8TAP9 179 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 LRTOMTQ8WZ04 291 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZDHHC12Q96GR4 267 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 MARK4Q96L34 752 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRMOQ9BU70 441 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 CHST8Q9H2A9 424 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM204AQ9H8W3 233 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM184CQ9NVA4 438 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 HDAC9Q9UKV0 1011 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 ASAP1Q9ULH1 1129 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 FZD4Q9ULV1 537 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 RAB27BO00194 218 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 SCGB1D2O95969 90 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 HRGP04196 525 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 CBSLP0DN79 551 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 TPH1P17752 444 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 RBL1P28749 1068 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 TACR3P29371 465 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 CCKARP32238 428 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 CBSP35520 551 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 COPAP53621 1224 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 GPC5P78333 572 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 FMO1Q01740 532 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 MIDNQ504T8 468 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 ODR4Q5SWX8 454 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 MZT2AQ6P582 158 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 SESTD1Q86VW0 696 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 TCEAL8Q8IYN2 117 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 MAGEB6Q8N7X4 407 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 APIPQ96GX9 242 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 VPS50Q96JG6 964 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 MSLNLQ96KJ4 702 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 SELENOOQ9BVL4 669 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 LRRC27Q9C0I9 530 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 POT1Q9NUX5 634 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 SEMA5BQ9P283 1151 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 DNAJB11Q9UBS4 358 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 OGDHLQ9ULD0 1010 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 CAPN11Q9UMQ6 739 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 COL15A1P39059 1388 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 CD8B2A6NJW9 211 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 FYB1O15117 783 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 PSG1P11464 419 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 BTF3P20290 206 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
RNU6-601P-201ENST00000384540 HTR7P34969 479 aa3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms